可以；
1、《劳动合同法》第三十六条、第四十六条规定，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。用人单位应当向劳动者支付经济补偿。
2、本案中公司因客观原因将厂址从黄埔区搬到白云区，两地相距较远，属于劳动合同中重大事项的变更，公司根据孙某的意愿解除双方的劳动关系，属于协商一致解除劳动合同，应向孙某支付经济补偿。
3、劳动合同履行过程中，公司经营场所的搬迁、因政策调整企业整体改制、不可抗力等属于劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行的情形。
4、对此，用人单位和劳动者协商后可以解除劳动合同，但用人单位应依照《劳动合同法》第四十六条的规定向劳动者支付经济补偿金。
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