有区别。公司规章制度包括员工手册。
具体如下：
1、规章制度与员工手册是不同的。公司的规章制度的范围要大于员工手册的范围。公司的规章制度包括多方面的内容，涉及到公司的方方面面，自然包括员工管理制度；而员工手册的内容主要针对员工管理方面。
2、员工手册主要是企业内部的人事制度管理规范，同时又涵盖企业的各个方面，承载传播企业形象，企业文化功能。它是有效的管理工具，员工的行动指南，主要针对员工个人。
3、规章制度主要是有关劳动纪律、行为规范等方面，它是一种管理。而员工手册是是一种管理方式，是告知宣传手段，按规格级别来说规章制度是更高一级的管理，应该是包括员工手册的。
4、规章制度是从内容上来讲的,员工手册是从形式上来讲的,其实员工手册的内容就是单位的规章制度,很多单位都是把自己的规章制度作为劳动手册内容的一部分的。
拓展资料：
员工手册属于员工息息相关的制度性文件，对与员工日常相关的制度进行了阐述，但不应该是全部制度文件的总和。例如我们单位员工手册分为入职程序、劳动纪律、薪金福利、奖励处罚、劳动合同制管理、员工关系等几个板块，而手册中关于培训、福利政策等只做了提纲性概述又有单独的考核管理办法。
员工手册所包含的企业成立企业文化组织架构员工职业规划等内容,在规章制度里是没有具体说明的。员工手册收到企业制度的制约和管理，公司的制度范围更广更大，员工手册为辅，制度为主。
规章制度是本，员工手册是节。企业规章制度才是企业的根本，是企业的宪法，是企业管理、运行的依据。员工手册是为了使员工知道一些涉及员工切身利益的内容，而编写的易于员工学习掌握的小册子。
劳动合同法实施后，其意义在于，企业提出员工违纪，有法可依，若没有员工手册，只有规章制度，也是可以的，可以组织员工学习规章制度，组织培训，并考试，这样一旦发生争议，企业可以说，已经明示了，但这样做企业可能会牵扯很大的经历，并且不易于操作，因此才采用发放员工手册，这种简便易行的方式。
故企业制度是根本，员工手册只是宣传企业制度的一种手段。
员工手册主要是企业内部的人事制度管理规范，同时又涵盖企业的各个方面，承载传播企业形象，企业文化功能。它是有效的管理工具，员工的行动指南。
公司规章制度包括的方面更多些，
如：
1、根据企业涉及到的法律法规，制订出了管理标准，比如环保管理制度、食品安全管理制度、安全生产管理制度、职业病防治制度、消防管理制度等。
2、根据企业的管理要求，制订出考勤值班制度、出入门管理制度、劳保发放制度、卫生管理制度等。
3、根据企业的机构设置，制订出各职能部门、个人的工作标准，比如人力资源部岗位职责、动力设备部岗位职责、财务部岗位职责、经理岗位职责、副经理岗位职责、人力资源部部长岗位职责等。
应该是包括员工手册的。本回答被提问者采纳
所以说员工手册包含公司规章制度，但同时还包含一些别的内容。