法律分析：区别在于实发工资不一样。
具体分析如下：
（1）含五险一金, 就是工资中包含了个人缴纳部分，每月从工资5000中直接扣除，你实际拿到的钱少于5000元。
（2）不含五险一金， 则是保险和公积金的个人缴纳部分已扣除后，实发工资为5000元。
最终解释应劳资双方共同认可，或在劳动合同中明确写出。免得以后因解释权归属问题闹翻脸。
五险一金，是在你的工资里面扣除的，根据国家规定，由企业从职工的工资中代为扣缴，如果你工资5000元，扣缴了社保以及住房公积金后，就不足5000了，其中养老保险是8%，医疗保险是2%，失业保险是1%，生育保险和工伤保险单位承担，你是不缴费的，住房公积金，根据企业自身情况确定，可多可少，但是不能低于5%。
如果工资不包含五险一金，工资是5000，则实发工资为5000。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》 第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。