普通pcr引物设计和荧光定量pcr引物设计的区别

如题所述

一、方法不同

1、普通pcr引物设计:引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。

2、荧光定量pcr引物设计:通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,标记跟踪PCR产物进行实时监测反应,利用与之相适应的软件对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度

二、原理不同

1、普通pcr引物设计:为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。

2、荧光定量pcr引物设计:在PCR反应体系中加入荧光基团,通过荧光信号不断累积而实现实时监测PCR全程,然后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在实时荧光定量PCR中,对全程PCR扩增过程进行实时检测,根据反应时间和荧光信号的变化可以绘制成一条曲线。

三、注意事项不同

1、普通pcr引物设计:引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异性。产物不能形成二级结构。引物长度在15~30碱基之间。

2、荧光定量pcr引物设计:实时荧光定量 PCR 仪应安放在湿度较低、灰尘较少、远离水池的平稳台面上,不能有强光直射,室内应通风良好,无腐蚀性气体 

参考资料来源:百度百科-荧光定量PCR

参考资料来源:百度百科-PCR引物设计

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第1个回答  2018-06-27
实时定量的引物设计要求比较高,可以按普通引物设计的方法来做,但是设计时要注意扩增的片段不能太大,最好在250bp-100bp之间。同时要保证这对引物有绝对的特异性,因为要是产生非特异性扩增的话,就不能准确的计量模板量了,这样就失去了实时定...本回答被网友采纳
第2个回答  2015-11-10
NF-KBmRNA不就是NF-KB的mRNA么 做定量PCR就是测它mRNA的表达量啊 NF-KBP65是NF-KB3 NF-KBP52是NF-KB2 所以这两个还是有区别的 如果你是要检测65的话
第3个回答  2015-11-10
建议你还是选择CDS区不一样的地方设计引物吧,这样可以避免交叉污染引起的非特异扩增,扩增的序列长度不一定要一样,每个引物你最好设计两三对,然后做一个相对定量看看不同引物的扩增效率,选择比较好的两对引物做后续试验,内参基因的引物不需...
第4个回答  推荐于2017-11-21
实时定量的引物设计要求比较高,可以按普通引物设计的方法来做,但是设计时要注意扩增的片段不能太大,最好在250bp-100bp之间。同时要保证这对引物有绝对的特异性,因为要是产生非特异性扩增的话,就不能准确的计量模板量了,这样就失去了实时定...本回答被提问者采纳
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