法律分析：1、你没有办理离职手续，那么公司就不会给你社保手册和劳工档案，还有离职证明，那么你社保就无法办理成个人缴纳，或者转移到其他公司；
2、你签合同的，公司可能在劳动局那里背书你的离职情况，你辞职找工作后，新的单位可以查看到你的不良记录；
3、公司跟你签的协议，有点霸王条款，你应该先咨询一下律师，再做出辞职决定，当然你违约在前，是要赔偿违约金的，但是你应该考察劳动法关于违约金的规定，公司要你赔偿的违约金太高了。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第三十七条 劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。如果双方有培训协议，则需要履行用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。不办离职手续，不能让单位完成相应的工作交接、有序进行工作任务的相应调整，可能会给单位造成相应的损失。建议你提供书面申请说明具体情况，正常离职；如果因个人紧急原因建议与所在单位协商一致，解除劳动合同。