一是看工龄，二是看省份。如果资历差不多，工资差别很小。如果工龄差别大，可能二级比一级工资高也是常见的。目前公务员的薪资=基本工资+工龄工资+补贴+奖金。工资两年一次调整，也就是说，两年加一次工资。一级主任科员比二级主任科员的工资直接高出两三百，其他的补贴待遇同样会有所差别。
不管是一级主任科员还是二级主任科员，都是正科级公务员，提拔副处的机会都是一样的，只要符合条件就可以晋升为副处级干部。但如果提升的是职级，一级主任科员与二级主任科员的差距就非常大了。
一级主任科员是主任科员里面的天花板，也是晋升四级调研员的必备条件。一级主任科员只要任职满两年，同时有职数名额，就有机会晋升四级调研员，而其他职级要想晋升四调，首先要晋升为一级主任科员。
二级主任科员，尽管在基层也有职数限制，但是二级主任科员也可以通过职级晋升一级主任科员，甚至少数人还可以晋升到四级或者三级调研员这个级别。
正科实职和一级主任科员都可以晋升副处实职，但是一级主任科员可以晋升四级调研员，正科实职不可以，必须先晋升一级主任科员才可以。这样看一级主任科员发展空间更大一些。可是对于副处实职来说，一般都会从正科实职中选拔产生，而不会从一级主任科员这个职级干部中产生。
一级主任科员和二级主任科员，单纯地比较这两个级别的公务员工资，也就是基本工资差别在两三百，但现实中公务员的工资跟工龄、任职时间及所在单位、地区都有很大的关系，所以综合比较下来，那具体高出多少就比较难以确定。
小何是我们单位上的一个科长，属于正儿八经的实职干部，但是前不久和单位的领导较劲，目的就是为了争取一个一级主任科员。小何的条件是够了，毕竟担任正科级的领导年限也按照规定达到两年了。
只是单位是有编制的，老何所在的单位目前正好有一个一级主任科员的位置，原来这个岗位同志正好年前退休了，空出来的名额，老何按道理就替补上了，但是上面领导出于要考虑比小何工龄长的老同志的意见，毕竟他们也就几年就退休了，而小何才三十几岁，机会还比较多。
单位新同事很不解，何科长这么放着实职不做，非要争取一级主任科员这个非领导职务，后来才得知，何科长要想晋升更高层级的四级调研员，那么一级主任科员是必经之路。况且，当上一级主任科员，明面上基本工资直接增加三百左右，其他的职业年金和公积金都不一样。
目前公务员的薪资构成是这样的，薪资=基本工资+工龄工资+补贴+奖金。工资两年一次调整，也就是说，两年加一次工资。具体薪资如下：
1）基本工资。套改前，公务员基本工资根据级别这样分的，办事员2800元；科员3000元；副科级 3100元；正科级 3300元；副处级 3600元；正处级 4000元；副厅级 4400元；正厅级 5000元……，一级主任科员和二级主任科员都属于正科级，套改后，基本工资将会有细分，两三百左右。
2）工龄工资。工龄是按照每年60元来计算，三年一次调整。
3）奖励工资。这个也是三年一次调整的，正常每月300元，如果年度考核不合格者次年1月停发，直至考核合格的次年1月继续发放。
4）补贴。一般来说，有车补、出勤补助、山区补助和一些地区差别补助等等。
所以，一级主任科员和二级主任科员，在职级上不同，基本工资和补贴也略有差别。
1.在重要性上有所差别。尽管一级主任科员和二级主任科员都属于正科级，但是套改后，如果想要晋升四级调研员，那就必须要有一级主任科员的任职经历，也就是说，要想成为副处级干部，就必须先从二级主任科员晋升一级主任科员。
2.层次上还是略有区别。从层级上来看，二级主任科员是小正科，一级主任科员是大正科。
3.在待遇上也有差别。目前国家公务员职级套改后，还没出台详细的待遇细则，但根据各地区执行的情况来看，一级主任科员比二级主任科员的工资直接高出两三百，其他的补贴待遇同样会有所差别。
总之，以上的比较只是基于同一个人在职务晋升的工资差别，或者同一个单位工龄差不多的公务员待遇差别，真正比较一级主任科员和二级主任科员，需要考虑更多因素才能综合比较。
一级主任科员的工资比耳机主任科员的工资要高400左右，扣除社保，两金之后大概相差200元到300元左右，所以说 一级主任科员和二级主任科员的工资差距不大。
根据《公务员法》规定，公务员的工资包括基本工资、津贴、补贴和奖金，公务员的工资会定期进行和企业相当人员工资水平的调查比较，作为调整公务员工资水平的依据。
1、公务员的工资构成
对于大多数人来说，公务员的工资都是比较神秘的，大多数人都认为公务员的的工资普遍高，但是具体有多高就不知道了，其实公务员的工资没有想象的那么高，因为这也是按照公务员的职务和级别计算的，那么一级主任科员和二级主任科员的级别其实是一样的，都属于正科级，但是以及主任科员时大正科，而二级主任科员是小正科，在工资主体部分是一样的，像车补、年终绩效等都在一个档次上，扣除了社保和两金之后相差只有百把块钱。所以如果是二级主任科员晋升一级主任科员，级别工资是不变的，职级工资会上涨70元左右。但是在津贴补贴上会有变化，大约能涨200元左右。但是各地的津补贴执行标准不一样，差异也就有所不同。
2、实质性差别在哪里
从工资待遇上看，一级主任科员和二级主任科员几乎没多大差别，但是在晋升方面就不一样了，要想晋升为四级调研员那就必须有一级主任科员的任职履历，就是说你想要的迈进处级门槛，一级主任科员是一个重要环节，那作为二级主任科员升到一级主任科员可不是涨了几百块钱的问题，而是终于有机会晋升处级了。当然如果对晋升没有多大兴趣，只求安稳，一级主任科员的收入和二级主任科员的收入相差不多，主要是各地在公务员津补贴上有各自的标准，而年龄也是工资差距的重点，如果二级主任科员年纪要比一级主任科员大，那么在级别工资上二级主任科员就会比一级主任科员高。经济欠发达地区的一级主任科员就比不上发达地区的二级主任科员的收入。可一级主任科员晋升就要占很大优势。
3、最后的重点
不管是什么级别，从工资这一块来说，只有晋升才会比原来拿的工资更高，其他各项津补贴也越高，特别是发达地区的公务员工资还是相当不错的，而且公务员的工资、福利、保险、退休金都是列入财政预算的，国家是给予保障的。如果在经济特区的公务员还有特区津贴，在大使馆工作的公务员还有地区津贴和配偶补贴，所以很多人说公务员是金饭碗还真是不过分，毕竟他们的工资都有国家保证，能够按时足额发放，这也是其他单位所不能比的优势。
总的来说，一级主任科员和二级主任科员工资相差不大，但是从长远来说，一级主任科员的前途要更光明，也是晋级进入处级的必要阶段，而且一级主任科员是领导职务，而二级主任科员不是领导职务，这也是不少正科级干部特别在意一级主任科员这个位置的重要原因。
本回答被网友采纳差距不大，根据不同地域，工资差别应还在小几百元左右。