明清之际的思想顺应了明清时期的商品经济的发展。但是：
经济：但明清时期商品经济受到政府压制，所以并没有发展壮大起来，相应的思想也未能成为主流。
政治：明清之际的思想有君主批判思想，而明清时期在政治上专制主义空前加强，皇权至上，肯定压制这种君主批判思想，所以没能成为时代潮流。
思想：维护君主专制的宋明理学占据统治地位，禁锢了人们的思想，八股取士，使得人们只知埋首故纸堆中。
总的来说，是因为当时的商品经济有一定发展，但又未能充分发展（发展成资本主义经济），所以人们的思想还是比较封建，无法对明清之际的活跃思想形成共识，加上政府在政治上的专制打击，所以未能成为思想主流。
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