乳杆菌16srDNA序列分析 先提取DNA然后PCR,扩增后纯化一下直接送去测序还是需要载体连接后才能送去测序?

2者有什么区别

PCR纯化之后直接送测序也是可以的,但是测序结果前面有几十个碱基是不准确的
所以严格来讲还是应该克隆后再测序,选用克隆载体上的引物可以完整准确的测出16SR序列追问

谢谢哦

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第1个回答  2012-06-07
不纯化也可以送测,测序结果回来取有效的一部分进行比对,如果相似性较低(97.5%左右),然后再做TA克隆,以获得16S的全长。(如果你要做新种鉴定的话)
直接测序的话,一开始的几十个bp不准确,而且几百个bp之后的序列可靠程度也不是很高。做完TA克隆再测序,基本上可以得到16S的全长。
第2个回答  2012-06-06
哇塞,期待高人,表示连题目都没看懂!
第3个回答  2012-06-06
都可以的
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