主线剧情必看：
001云霄飞车杀人事件（组织）
043江户川柯南诱拐事件(父母知道变小)
048~049外交官杀人事件(平次登场，第一次恢复)
054电玩公司杀人事件（组织）
057，058福尔摩斯迷杀人事件(平次知道身份)
128黑衣组织10亿元抢劫事件
129来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件（组织）
170，171暗阁中的死角（新出登场）
176，177，178与黑暗组织的再会（组织）
188－－193危命的复活（新一，兰）
226，227格斗游戏的陷阱（朱蒂登场）
230，231谜一样的乘客（赤井登场）
258，259来自芝加哥的男子（詹姆斯登场）
269，270犯罪的纪念品（有提到警察局关于毛利的案卷被偷一事）
271，272紧急隐藏的省略（朱蒂）
277，278英语教师VS关西侦探（朱蒂）
284~285中华街雨中的似曾相识
286，287，288工藤新一NY事件（不用多说了吧）
307，308无声的证据（组织相关，下一集的引子）
309，310，311与黑色组织的接触（组织）
335，336东都显影所的秘密（有神秘人）
338，339 4辆保时捷（朱蒂和贝尔摩德假扮的新出发现哀）
340，341隐藏在厕所里的秘密（更多关于哀父母的消息，找到明美藏起来的录音带）
343，344便利店的陷阱（最后一段是小兰发现朱蒂藏的照片，怀疑朱蒂）
345与黑衣组织直面对决满月之夜的双重迷案（不多说了）
346，347寻找P股上的印记（上集案件的扫尾，关于哀拒绝证人保护计划的事）
385-387 斯特拉迪瓦里小提琴的不xx音
425 黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间(水无怜奈登场，小五郎受到怀疑，若不是秀一就挂掉了)
429--430无法回到从前的两个人(本堂)
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
507 卡拉OK房间的死角（前篇）
508 卡拉OK房间的死角（后篇）
还有些集案件本身没什么，其间就一两句话和组织的事有点关系或者哀的话暗藏玄机
130--131竞技场无差别胁迫事件(故事内容和主线情节无关，但灰原讲的一句话曾让广大柯南迷浮想联翩：“工藤君，也许你自己不知道，其实半个世纪前你就在组织的计划中了”。这究竟是怎么一回事？半个世纪前优作大概都没出生呢！看来只有等青山来解释了。)
222--224招致死亡的人鱼传说（人鱼小岛签名册有宫野志保的名字）
242元太的灾难（好像提到GIN是左撇子)
246--247网中的谜事件（哀和兰握手）
253－-254本厅刑事恋爱物语(本身案件无意义，不表。有两个值得注意的地方是，一是小兰在饭店里看到赤井秀一居然有似曾相识的感觉，二是柯南和新出合力扮演了高木警官，一个出身材和动作，一个出配音。望月以为，有可能就是从这集开始，柯南对新出的身份产生了怀疑。因为他注意到了新出超强的模仿能力。)
279--280迷宫的阴暗（这集哀说了很多话;主线情节只被带到了一点。博士应柯南的要求去克里斯的网站上查过信息。发现她就是美国已故大明星莎隆.宾亚德的女儿。在母亲的葬礼上，面对记者的追问，克里斯曾神秘的回答道：A SECRET MAKES A WOMAN WOMAN.另外，有希子也出现在了莎隆的葬礼中，但是她的帽檐压的很低，所以美国的网站上显示当时并没有人认出有希子的身份，只是谣传说日本的前人气女明星也出席了葬礼。）
289--290迷惘森林中的光彦（上下集）（有提到哀对组织气味已经不敏感了。和沼渊已一郎是组织一员的事。）
312--313染上夕阳的布偶（哀说了关于夕阳的话）
329-－330金钱买不到的友情(本集中提到了灰原的父亲：宫野厚司。原来他是化学领域非常有名的科学家，被称为“被科学界放逐的疯狂科学家”，待人和气有礼，并且是阿笠博士的旧识。)
精彩剧集：
首推剧场版1-10，11集无聊，12集很期待。
第一部： 1997 引爆摩天楼 (时计じかけの摩天楼/A Clockwork Skyscraper) 1997/04/23
第二部： 1998 第十四个目标 (14番目の标的/The Fourteenth Target) 1998/04/15
第三部： 1999 世纪末的魔术师 (世纪末の魔术师/Last Wizard of the Century) 1999/04/14
第四部： 2000 瞳孔中的暗杀者 (曈の中の暗杀者/Captured In Her Eyes) 2000/04/12
第五部： 2001 通往天国的倒计时(天国へのカウントダウン/Count Down To Heaven) 2001/04/11
第六部： 2002 贝克街的亡灵 (ベイカー街の亡霊/The Phantom of Baker Street) 2002/04/17
第七部： 2003 迷宫的十字路 (迷宫の十字路/Crossroad in the Ancient Capital) 2003/04/19
第八部： 2004 银翼的魔术师 (银翼の奇术师）/Magician of the Silver Sky) 2004/04/17
第九部： 2005 水平线上的阴谋 (水平线上の阴谋/Strategy above the Depths) 2005/04/09
第十部： 2006 侦探们的镇魂歌 (探侦たちの镇魂歌/The Private Eye's Requiem) 2006/04/15
第十一部：2007 绀碧之馆 (绀碧の棺/Jolly Roger in the Deep Azure) 2007/04/21
第十二部：2008 战栗的乐谱 (戦栗の楽谱/Full score of Fear) 2008/04/19日本上演
再推特别编，几乎个个精彩：
特别篇01-011 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件 1小时特别篇
特别篇02-052 雾天狗传说杀人事件 1小时特别篇
特别篇03-076 柯南vs怪盗基德 1小时特别篇
特别篇04-096 走投无路的名侦探！连续两大杀人事件 2小时特别篇
特别篇05-118 浪花连续杀人事件 1小时特别篇
特别篇06-129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件 2小时特别篇
特别篇07-162 空中飞行的密室 工藤新一最初的事件 1小时特别篇
特别篇08-174 20年的杀意 圣佛尼号连续杀人事件 2小时特别篇
特别篇09-184 诅咒的假面在冷笑 1小时特别篇
特别篇10-208 迷宫的入口 巨大神像的愤怒 1小时特别篇
特别篇11-219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德 2小时特别篇
特别篇12-263 大阪双重谜团 浪花剑士和太阁之城 2小时特别篇
特别篇13-304 震动警视厅 1200万名人质 2小时特别篇（隆重推荐，同属恋爱物语系列）
特别篇14-342 豪斯登堡的新娘 1小时特别篇
特别篇15-345 与黑衣组织正面对决 满月之夜的二元推理 2.5小时特别篇
特别篇16-356 怪盗基德的惊异空中步行 1小时特别篇
特别篇17-383 甲子园的奇迹！绝不能输给看不见的恶魔 2小时特别篇
特别篇18-425 黑暗冲击！被组织的魔爪触碰的瞬间 2.5小时特别篇
特别篇19-449 本厅的刑警恋爱物语 虚假的婚礼 1小时特别篇
特别篇20-452 金比罗剧院的怪人 1小时特别篇
特别篇21-479 和服部平次在一起的3天 2小时特别篇
特别篇22-487 本厅刑事恋物语8 左手的无名指 1小时特别篇
特别篇23-488 电视台的恶魔 1小时特别篇
特别篇24-489 法庭的对决Ⅲ 目击者是检察官 1小时特别篇
特别篇25-490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决 1小时特别篇
三推KIDD：
076《柯南对怪盗基德》
132《魔术爱好者杀人事件（事件篇）》
133《魔术爱好者杀人事件（疑惑篇）》
134《魔术爱好者杀人事件（解决篇)）》
219《名侦探大集合 工藤新一VS怪盗基德》
356《怪盗基德之奇异的空中步行》
394《奇异屋宇的大冒险（封印篇）》
395《奇异屋宇的大冒险（机关篇）》
396《奇异屋宇的大冒险（解决篇) 》
469《基德与四幅名画（前篇) 》
470《基德与四幅名画（后篇) 》
473《工藤新一少年时的冒险》
剧场版：
三《世纪末的魔术师》
八《银翼的魔术师》
十《侦探们的安魂曲》
四推恋爱物语系列：
146-147本厅刑事的恋爱物语
柯南他们去录口供之类的，正式与佐藤见面，高木猜测佐藤到底喜欢谁的时候很有意思。
156-157本厅刑事恋爱物语2
佐藤在抓捕犯人时，不慎与犯人一起锁在了马上要爆破的废楼厕所里。当了解到犯人可能有冤情后，佐藤让高木在有限的时间内找出真凶，并且回来救她们两人。佐藤得救后的情节非常好笑。
205-206本厅刑事的恋爱物语3
很感人的一话。佐藤的父亲在她很小时就因为抓犯人殉职了，而犯人却没有抓到。在父亲祭日那天，听到佐藤的故事后，明白“愁思郎事件”真相的高木警官却被犯人袭击，被关在了着火的小屋中。尽管身处险境，却仍然不愿弄坏佐藤父亲遗物的高木本话中的表现非常强眼。
253-254本厅刑事恋爱物语4
佐藤相亲了，对方居然是那个白鸟！两人居然还打赌如果高木不能在日落之前赶来就订婚！！而且有订婚吻哦~最后虽然高木抓到了犯人，却好像来不及赶去给佐藤解围了。到底赌约的结果如何呢？
358-359本厅刑事的恋爱物语5
最好先看一下前面的那几集再来看这集。了解一下松田后，会觉得这集又好笑又感人。高木与佐藤的第一次约会，警事厅大部分男警察也都同时请假，由白鸟指挥坚决要扰乱这次约会。
390-391本厅刑事恋爱物语6
听说警部要派叫高木的警官去鸟取县破案，最快也得3年才能回来，高木要怎么办呢？
431-432本厅刑事的恋爱物语7
不约而同，两人都去参加同一个联谊，当然都成了大醋坛。联谊未结束却遇到了小孩子的绑架案。
449 本厅刑事恋爱物语7---虚假的婚礼
487 本厅刑事恋爱物语8---左手的无名指
五推超级感人剧情：
011 钢琴奏鸣曲“月光”杀人事件（火光映红的夜空，今夜，月影岛上还能看见月亮吗？“月光”奏鸣曲行云流水般的旋律，听起来却只剩下夜一般沉寂的悲伤，那被火焰吞噬的苦涩的微笑，遗憾伤感的不仅仅是柯南一人。如此纯洁的音乐，不应被罪恶玷污。父亲希望的，应该也是孩子能幸福快乐的活下去，而不是在复仇的毒蛇的驱使下，走上那条不归路。）
018 六月新娘杀人事件 （因为柯南的一句“3年后”造成了非议）
027 小五郎同学会杀人事件（前篇）
028 小五郎同学会杀人事件（后篇） （这两集是柯南和小兰一起洗澡，还让我们看到毛利也不糊涂）
037 仙人掌花杀人事件
042 卡拉OK歌厅杀人事件 （悲惨的结局，两个相互错过的人，一个不愿意承认事实的青年，跟一个隐藏面貌的女子，就这样错过了幸福，写下了悲剧。在她悲伤的哭声和眼泪中，只有那张照片，还在悲伤的笑着。离第一次看这个案件已过去很多年了，可尾声的这段话却留在记忆里久久不能忘怀。可能因为这是柯南第一处让我有冲动想流泪的地方，连空气里仿佛都浸渗着那种黯然神伤的情绪。应了那句老话：明明相爱，为什么要互相伤害！和朋友谈起这个案件的时候，她淡淡一句：“死了也是活该。”无语。活该？也许吧，如果他们能坦诚相见，如果没有那么多面具下的隐藏，如果．．．．．．可是这个世界真的是没有这么多的如果的，所以我们只有不断前行，带着伤带着泪也要不断前行，不能回头！）
077-078 名门连续惨死事件（没错，这就是我们的大侦探说出“我们侦探把犯人逼到尽头，如果最后就让他们自我了结的话，那和杀人犯有什么不同”的名言的那一集，而让他将这个信念贯彻实施的正是日向幸这个女子。坦白说日向幸与长门秀臣之间的爱情悲剧指数绝不输给上面那对，但可能是新平这对黄金搭档的演出太精彩了，那段名言又太如雷贯耳了，案件本身反而没什么人记得了！
“这是我跟他之间的命运，我们从好久以前就已经被火的牵绊绑在一起了．．．．．．”
“因为我不希望让他这样泡在那么冰冷的池水里面．．．．．．”
“不能原谅．．．．．．不过我自己．．．．．．却已经无可救药的爱上他了！”）
095 小五郎约会杀人事件 （再来见识一下毛利吧~~~）
100 初恋情人回忆事件（前篇）
101 初恋情人回忆事件（后篇） （这两集总体给人的感觉是蛮悲惨的）
116 推理小说家失踪事件（前篇）
117 推理小说家失踪事件（后篇） （其实也是挺悲哀的）
136 蓝色古堡探索事件（前篇）
137 蓝色古堡探索事件（后篇）（超级恐怖，为了毫不存在的“宝藏”，把自己整成老太婆）
153 园子的夏日海滩冒险物语（前篇）
154 园子的夏日海滩冒险物语（后篇） （园子的“黑马王子”终于出现了。兰在救园子，用脚踢破车窗的镜头真是百看不厌）
166 鸟取蜘蛛公馆的怪事（事件篇）
167 鸟取蜘蛛公馆的怪事（疑惑篇）
168 鸟取蜘蛛公馆的怪事（解决篇）（“‘为什么自己不是日本人？为什么她不是美国人？’就像是故障的扯线公仔一样，重复．．．．．．又重复着”
因为语言不通造成的误会，竟致一对相互爱恋的男女就此天人永别，进而演绎出一幕惨剧。沉浸在新平推理秀及蜘蛛公馆诡秘气氛中的观众们，还没忘记这一对错过得比窦娥还冤的情侣吧。虽然不喜欢这家伙，因为能想出那种杀人手法及死状的人铁定心理不太正常，而且居然敢对偶们家和叶小妹痛下杀手（虽然未遂），想被平和迷们丢去喂蜘蛛么！不过看在人家痛失爱侣的份上，蛮可怜的，也算你一个吧。）
201 第10位乘客（前篇）
202 第10位乘客（后篇） （经典）
203 黑天使之翼（前篇）
204 黑天使之翼（后篇） （还是经典）
210 五彩传说的水中豪宅（前篇）
211 五彩传说的水中豪宅（后篇） （KID的出现）
212 蘑菇、熊和侦探队（前篇）
213 蘑菇、山和侦探队（后篇） （光也对哀产生了情感）
217 目暮尘封的秘密（前篇）
218 目暮尘封的秘密（前篇） （目暮为什么老是戴帽子，秘密在这里）
220 满口谎言的委托人（前篇）
221 满口谎言的委托人（后篇） （平次的妈妈出现）
222 人鱼又再度悲泣（事件篇）
223 人鱼又再度悲泣（推理篇）
224 人鱼又再度悲泣（解决篇） （超级经典！平次对和叶迷迷糊糊的话语，在表白吗）
238 大阪3K事件（上集）
239 大阪3K事件（下集）（“不行，雷，无论你遇到多么不幸的事情，都不是你吸毒和杀人的借口，只能得到可耻的红牌。”当柯南说出这句话的时候，可以想见其内心的痛苦。之于偶像，有时并不只是一个喜欢的对象，他可能更像是一个完美的憧憬。这也是为什么神圣的光环一旦消逝，心里会有失望、苦痛、愤怒的原因，像心爱的瓷娃娃一瞬间被无情的打碎了，一个令人愉快的梦醒了。法理与人情，公私分明谁都会说，真要一丝不苟的执行其实很难很难，情非得以，情难以堪呀！雷犯的罪，其实没什么可原谅的，但看在他是新一的偶像，把他也列出来，算是代新一徇一次私吧。）
266 情人节的真相（事件篇）
267 情人节的真相（推理篇）
268 情人节的真相（解决篇） （为了哥哥报仇，杀了自己的爱人）
291 孤岛的公主与龙宫城（事件篇）
292 孤岛的公主与龙宫城（追求篇）
293 孤岛的公主与龙宫城（解决篇） （平次、和叶、兰、柯南）
323 服部平次走投无路！（前篇）
324 服部平次走投无路！（后篇） （受伤了）
376 限时15时
381 谁的推理秀（前篇）
382 谁的推理秀（后篇）
400 心存疑惑的兰（兰怀疑柯南）
406 柯南和平次的推理魔术(装置篇)
407 柯南和平次的推理魔术(公馆篇)
408 柯南和平次的推理魔术(解决篇)
421 银杏色的初恋（前篇）
422 银杏色的初恋（后篇） (关于阿笠博士的初恋,很感人)
437 上户彩与新一 4年前的约定 (有新一在的就是经典)
最后说说柯哀（由于我是站在新兰一边，所以总结的不全）：
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件（哀趴在柯南身上哭得声嘶力竭，这大概是哀最本色的时候吧）
超人气偶像灰原哀的登场（灰原是望月看了N年漫画以来喜欢上的第一位女性角色，对其喜欢程度简直让望月怀疑自己是否有了恋童癖）。这个酷劲十足的MM智商超群，推理能力仅比柯南稍逊一筹，并且有着谜一般的过去。与小兰不同的是，小兰过于完美，而灰原正是有着所谓的“人格缺陷”，反而让人觉得比小兰更耐看，更有味道。
评论：灰原登场的影响是深远的。不仅是柯南的内容由简单的推理秀开始向主线故事情节发展的标志，也是柯南开始反弹的开始。之前由于推理内容开始重复并且已经到了一定的集数，使得观众开始逐渐对柯南失去了兴趣，收视率开始逐年降低。然而自从灰原出场以后，收视率爆增至排行榜首位并且高居不下，一举奠定了柯南在日本第一动漫的地位，而我们广大的柯南迷从此也开始分裂成新兰恋和新哀恋两大阵营。一切的一切，都说明灰原哀这个角色的魅力有多大！
经典画面：1/灰原开枪射击，酷到极点！！
2/故事结尾，灰原带着一丝让人琢磨不透的微笑对柯南说：看来我们要相处很长一段日子了，江户川君。柯南则是警惕的瞪视灰原。伴奏音乐响起，两人相对而立，背景是Gin和Vodka的巨大身影。顿时整个画面给人一种柯南和灰原双雄对决的气氛，感觉特别好！
136~137 青色古城探索事件
感觉不错的一集，
柯南和博士失踪后，灰原带领着侦探团寻找他们
感觉哀好强哦
176~178 与黑衣组织的再会
柯哀的重头大戏哦！
情节蛮紧张的……
中间灰原喝了点白干，变回志保，不过被Gin打了N枪，好可怜
灰原变大前被关在一个酒窖里，So……
变大后，柯南问她，你穿衣服没？
哀骂他素色狼，哈哈！！
212 蘑菇、熊和侦探队（前篇）
213 蘑菇、山和侦探队（后篇） （光也对哀产生了情感）
230－231迷一样的乘客 （车中炸弹要爆炸时，灰原仍然没有逃走，她想就此结束自己的生命。此时柯南再次出现，用灭火器砸碎了车窗，并且在炸弹爆炸前的一秒中抱起灰原跳出窗外，被炸弹的冲击波推出老远。绝对有好莱坞大片的影子。）
279~280 迷宫的阴暗
哀饭必看的一话哦
哀的著名的话
哀：你不是说过的吗？
柯南：……
哀：别逃 你不是说不要逃离自己的命运吗
柯南：……
哀：你会保护我的吧
柯南：呃…… 嗯
哀：我可不是你想的那种只会说保护我的富家小姐
340~341 厕所隐藏的秘密
博士找到哀的父母的线索
带着柯南和灰原去了解详情
却意外发现了她的姐姐明美藏在卫生间里的，小哀的母亲留给她的磁带
不错的一集哦，也是主线之一
还有喜欢的对白
柯南：这家伙 假哭你很拿手，装睡可就很差劲了你这家伙 干什么啊？明明特地来给你煮粥 还摆架子吗？
哀：没什么，又不是我让她来的
柯南：不过我也不是不知道你不是很习惯小兰这种喜欢照顾人的类型。她好容易辛辛苦苦煮的粥，在冷掉之前赶快给我吃掉。
哀（心里想）：你还是不知道 什么都不知道。不过我也并不希望你知道。
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案
主线剧集哦，部分谜团被解开
中间的人物……有点晕
扮过来扮过去的，有希子化妆技术虽高，这班人看得迷糊了
值得一提的，有新一的出场（随是某人扮的，看在比较像的份上就原谅他了）
不多说了，自己体味吧……
401~402 宝石抢匪现行犯
看过400的人都会意识到吧
柯南跟小兰说的喜欢的女生，是灰原哦
虽然是不得已骗她 但是，感觉好好
关键时候，柯南同学还是需要灰原作挡箭牌啊
还有案件…… 小哀的话真是一语中的
柯南那招，也蛮帅的
425 黑色的冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
不用我多说了吧
001 云霄飞车杀人事件(这个是初登场，所以也很值得纪念。其中某新对和兰接吻的遐想。。- - 这个是最早的新兰戏了）
010 足球选手恐吓事件（某新最后那句“我也会心疼”的话真是够煽情呀。俩孩子的小脸都红了。这个虽然是破案，其实整个都是围绕新兰。兰吃醋了，后果很严重。于是某新只能拿这种烂情话来补救了。。orz）
100-101 初恋情人回忆事件（既然是这个名字。自然是很有噱头的。其实是当年有女生像新一表白，但他说自己已经有喜欢的人了“她是我心中的女神”。小正太果然有爱。）
162 飞天密室工藤新一最初的事件（多么有爱啊。。新一和兰在飞机上。相当可爱呀。其实有很多有趣又甜蜜的桥段。觉得值得一看呐）
188-193 危命的复活（这个是一系列的，整个剧情都很精彩，如果要看新兰的，可以从191的黑衣骑士开始看。嗯。这个有非常经典的新兰接吻的戏。后面新一还邀请兰去当年他父母订婚的酒店吃饭。）
286-288 工藤新一NY事件（这个应该是162集的后续。整个故事的场景非常有feel.依然有有爱的桥段。然后还有新一扑救兰的情节。总之这个就是新兰剧情）
343-344 便利店中的阴谋（这个是兰的推理。其中一直贯穿着新一的支持。电话中的那些话也是73一贯用的手法。）
472-473 新一少年时的冒险（这个是小时候的故事。纯新兰。萌）
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考