百度百科中都有具体集数
新兰，集数挺多的
看百科吧
http://baike.baidu.com/view/54234.htm#5 几集印象深的
告白 剧场版M4瞳孔中的暗杀者
剧场版M8银翼的魔术师
616 福尔摩斯的默示录（名侦探的弟子）
617 福尔摩斯的默示录（Love is 0）
618 福尔摩斯的默示录（撒旦）
619 福尔摩斯的默示录（Code break）
620 福尔摩斯的默示录（草场女王）
621 福尔摩斯的默示录（0 is Start）
兰怀疑柯南的身份
007 每月一件礼物威胁事件
096 走投无路的名侦探-;
188 -193;
400 兰的疑惑;世纪末的魔术师
柯哀，还是建议看百度百科
http://baike.baidu.com/view/731697.htm 印象深的
230~231 谜一样的乘客
435~436 聚焦侦探团的取材
557 与危险同行的两人
597~598 温泉密室的剧本
主线
001云霄飞车杀人事件（组织）
043江户川柯南诱拐事件(父母知道变小)
048~049外交官杀人事件(平次登场，第一次恢复)
054电玩公司杀人事件（组织）
057，058福尔摩斯迷杀人事件(平次知道身份)
128黑衣组织10亿元抢劫事件
129来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件（组织）
170，171暗阁中的死角（新出登场）
176，177，178与黑暗组织的再会（组织）
188－－193危命的复活（新一，兰）
226，227格斗游戏的陷阱（朱蒂登场）
230，231谜一样的乘客（赤井登场）
258，259来自芝加哥的男子（詹姆斯登场）
269，270犯罪的纪念品（有提到警察局关于毛利的案卷被偷一事）
271，272紧急隐藏的省略（朱蒂）
277，278英语教师VS关西侦探（朱蒂）
284~285中华街雨中的似曾相识
286，287，288工藤新一NY事件（不用多说了吧）
307，308无声的证据（组织相关，下一集的引子）
309，310，311与黑色组织的接触（组织）
335，336东都显影所的秘密（有神秘人）
338，339 4辆保时捷（朱蒂和贝尔摩德假扮的新出发现哀）
340，341隐藏在厕所里的秘密（更多关于哀父母的消息，找到明美藏起来的录音带）
343，344便利店的陷阱（最后一段是小兰发现朱蒂藏的照片，怀疑朱蒂）
345与黑衣组织直面对决满月之夜的双重迷案（不多说了）
346，347寻找P股上的印记（上集案件的扫尾，关于哀拒绝证人保护计划的事）
385-387 斯特拉迪瓦里小提琴的不xx音
425 黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间(水无怜奈登场，小五郎受到怀疑，若不是秀一就挂掉了)
429--430无法回到从前的两个人(本堂)
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
507 卡拉OK房间的死角（前篇）
508 卡拉OK房间的死角（后篇）
578 召唤危机的红色凶兆
579 黑与13的暗示
580 逼近黑色时刻
581 红色飘摇的目标
服部，还是百度百科
http://baike.baidu.com/view/21534.htm 048 外交官杀人事件（前篇） 049 外交官杀人事件（后篇） 057 福尔摩斯迷杀人事件（前篇） 058 福尔摩斯迷杀人事件（后篇）（发现江户川柯南就是工藤新一这个秘密） 077 名门连续惨死事件（前篇） 078 名门连续惨死事件（后篇） 117 推理小说家失踪事件（后篇）*（引子以及打给出版社的电话） 118 浪花连续杀人事件 141 结婚前夜密室事件（前篇） 142 结婚前夜密室事件（后篇） 166 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（事件篇） 167 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（疑惑篇） 168 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（解决篇） 174 20年的杀意 新佛尼号连续杀人事件 189 危命的复活 负伤的名侦探 *（探望受伤的江户川柯南） 190 危命的复活 第三种选择 191 危命的复活 黑衣骑士 192 危命的复活 归来的新一* 221 满口谎言的委托人（后篇）*（引子） 222 人鱼失踪记（事件篇） 223 人鱼失踪记（推理篇） 224 人鱼失踪记（解决篇） 238 大阪的3个K事件（前篇） 239 大阪的3个K事件（后篇） 240 新干线护送事件（前篇）*（收尾） 263 大阪双重迷案 浪花剑士与太阁之城 277 英语教师VS关西名侦探（上） 278 英语教师VS关西名侦探（下） 291 孤岛的公主与龙宫城（事件篇） 292 孤岛的公主与龙宫城（追求篇） 293 孤岛的公主与龙宫城（解决篇） 323 服部平次一筹莫展（前篇） 324 服部平次一筹莫展（后篇） 325 火焰中的红马（事件篇） 326 火焰中的红马（搜查篇） 327 火焰中的红马（解决篇） 345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案 371 沉默的航线（前篇）*（一个镜头） 381 谁的推理秀（前篇） 382 谁的推理秀（后篇） 383 甲子园的奇迹 绝不能输给看不见的恶魔 406 柯南平次的推理魔术（操纵篇） 407 柯南平次的推理魔术（公馆篇） 408 柯南平次的推理魔术（解决篇） 479 和服部平次一起的3天 484 黑色照片的去向（前篇）*（告诉江户川柯南自己对本堂瑛佑的调查结果） 490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决 491 红与黑的碰撞开端 *（收尾） 509 红白黄色与侦探团 * （柯南回忆《火焰中的红马》情节） 515 怪盗KID的瞬间移动魔术*（引子） 516 风林火山 迷宫的铠甲武士 517风林火山 阴和电闪的终结 521 杀人犯-工藤新一 522 新一的真实身份与兰的眼泪 523 真正想问的事 524 令人憎恨的蓝色火花（前篇）◆*（给江户川柯南打电话） 554 鹳的探索之旅（兰搜索篇）◆ 555 鹳的探索之旅（阳菜追踪篇）◆ 572 妖怪仓库中的夺宝战斗（后篇）（也算，躲在仓库后面） 573 害羞的护身符的去向（前篇） 574 害羞的护身符的去向（后篇） 610 被害者是工藤伸壱（“工藤伸壱”和“工藤新一”读音相同） 611 犬伏城 炎之魔犬（鬼火之章） 612 犬伏城 炎之魔犬（足迹之章） 613 犬伏城 炎之魔犬（公主之章）
剧场版
Movie 3——《世纪末的魔术师》 Movie 7——《迷宫的十字路口》 Movie 8——《银翼的魔术师》*（平次确实有出现，在兰回忆《外交官杀人事件》中出现） Movie 10——《侦探们的镇魂歌》 Movie 13——《漆黑的追踪者》（柯南拜托平次帮忙调查一个几年前的案子） Movie 14——《天空的遇难船》
OVA
OVA 1 柯南VS基德VS阿剑！宝刀争夺大作战 * （柯南做梦变成平次） OVA 2 16个嫌疑犯 OVA 3 柯南与平次与消失少年 OVA 6 追踪消失的钻石！柯南&平次vsKID！ OVA 9 十年后的陌生人*（柯南梦中，10年后接受记者采访）
特典
M 8 特典 银翼的时间之旅*（断断续续的出现了几次） M 10 特典 感恩10周年！！柯南奖颁奖典礼 M 14 特典 通往大阪什锦煎饼艰险之路 M 15 特典 新泻东京礼物随想曲
基德，继续百度百科
http://baike.baidu.com/view/4542.htm 076 柯南vs怪盗基德 132 魔术爱好者杀人事件（事件篇） （易容出现） 133 魔术爱好者杀人事件（疑惑篇） （易容出现） 134 魔术爱好者杀人事件（解决篇） （易容，以怪盗基德样子出现） 219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德 （易容，以怪盗基德样子出现，小时候的快斗也出现了） 356 怪盗基德的惊异空中步行 （易容，以怪盗基德样子出现） 394 诡异宅院大冒险（封印篇） （易容出现） 395 诡异宅院大冒险（机关篇） （易容出现） 396 诡异宅院大冒险（解决篇） （易容，以怪盗基德样子出现） 469 怪盗基德与四幅名画（前篇）（易容出现） 470 怪盗基德与四幅名画（后篇）（易容，以怪盗基德样子出现） 472 工藤新一少年时的冒险（前篇）【一代】 473 工藤新一少年时的冒险（后篇）【一代】（但快斗也出现了，当时为七岁的快斗，只有一个镜头） 479 和服部平次在一起的三天（远影） 515 怪盗基德瞬间移动 （以怪盗基德样子出现） 537 怪盗基德VS最强金库（前篇） （易容出现） 538 怪盗基德VS最强金库（后篇） （易容，以怪盗基德样子出现） 571 妖怪仓库中的夺宝战斗（前篇）（江户川柯南在解释警视厅搜查各科的工作时出现过远影） 585 永恒的樱花之恋 （基德的预告) 586 消失在黑暗中的麒麟之角 （易容出现） 587 基德VS四神侦探团 （易容，以怪盗基德样子出现） 627 柯南基德的龙马宝物攻防战（前篇） （以怪盗基德样子出现） 628 柯南基德的龙马宝物攻防战（后篇） （易容，以怪盗基德样子出现） 剧场版出场 03 世纪末的魔术师 1999/04/14 08 银翼的魔术师 2004/4/17 10 侦探们的镇魂歌 2006/04/15 14 天空的遇难船 2010/04/17 OVA出场 1 柯南vs基德vs阿剑 宝刀争夺大决战!! 4 基德与水晶之母 6 追踪消失的钻石!柯南·平次VS基德! 10 怪盗基德孤岛决战 剧场特典出场 M 8 特典：银翼的时间之旅 M 10 特典：感恩10周年!! 柯南奖颁奖典礼 M 14 公开纪念特别篇 怪盗基德诞生的秘密 3D特别篇出场 (在日本才有上映,网络无资源) 柯南VS基德！漆黑的狙击手 柯南VS基德！鲨鱼和珠宝