主要区别有4点：
1、学制学位不同
五年制学制五年（最长可延长到八年）毕业为大学本科学历，符合学校要求者授予医学学士学位；
八年制学制八年（最长可延长到十年），毕业为大学研究生学历，所授学位大多为医学专业博士。
2、课程设置不同
五年制前三年在学校学习人文、自然和基础医学知识，后两年到附属医院或教学医院学习临床理论和技能；
八年制课程分为四个阶段：医学预科阶段，五个学期，在清华大学生物系进行；基础医学阶段，三个学期，在校本部基础学院进行；临床医学阶段（含见习），四个学期，在校本部临床学院进行。临床实习及科研训练阶段，四个学期，在博士生导师的指导下，独立完成一项科研题目并通过答辩。
3、学习计划不同
5年制前2年学习基础知识，中2年学习临床知识，后1年临床实习；
8年制基础知识学习时间更长，可能还要接触数理化之类的纯理科课程。临床阶段时间更长一点。但是临床医学部分的学习内容和5年制基本相同。
4、就业方向不同
五年制本科毕业生可以参加医师资格考试，获得执业医师资格证，便具备了行医的资格。当下，临床医学本科毕业生竞争力较低，大多只能选择到基层诊所、社区医院或一些民营医院；
八年制毕业可应聘三甲医院、医学高等院校、高级医学科研机构；博士后可申请国外高校博士后。
扩展资料：
医学院临床医学（八年制）相关制度：
1、实行导师制
将根据不同学习阶段，分阶段安排公共基础课、医学基础课、临床课的教师担任八年制学生的导师，为学生提供生活、学习方法等方面的指导和帮助。
2、实行分流和淘汰制
对由于各种原因不能适应学习者，实行分流和淘汰制，但不设具体淘汰率。在公共基础课程阶段、基础医学阶段和研究生培养阶段分别设立出口，对不能达到学校规定的相应要求或本人不愿进入下一阶段学习的学生，将实行分流或淘汰。
临床医学（五年制）相关要求规定：
1、掌握与医学相关的自然科学基本理论与方法
2、掌握医学基础学科的基本理论与方法
3、掌握临床医学学科的基本理论与临床技能
参考资料来源：
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