吸收口服本品后，阿奇霉素广泛分布于全身，生物利用度约37％，2-3小时血浆药浓度达峰。分布动物试验表明，吞噬细胞中存在高浓度阿奇霉素。试验模型发现，活化吞噬细胞比非活化吞噬细胞释放出更高浓度的阿奇霉素。该动物模型结果说明高浓度的阿奇霉素可被释放到感染部位。人体药代动力学研究表明，阿奇霉素组织浓度远高于血浆浓度（高出最大血浆浓度的50倍），单次给药500mg，肺、扁桃体及前列腺等靶组织内浓度高于大多数常见病原体的MIC90。每日口服阿奇霉素600mg，第1天和第22天的血药峰浓度分别为0.33μg/ml和0.55μg/ml。播散性鸟型胞内分支杆菌复合体主要感染白细胞，阿奇霉素在白细胞中的平均峰浓度为252μg/ml（±49%），稳态下其浓度24小时均可保持在146μg/ml（±33%）以上。消除血浆消除半衰期与2-4天时的组织消除半衰期密切相关。约12％的静脉给药剂量在3天内以原形从尿中排出，且大部分在最初24小时内排出。阿奇霉素口服后主要以原形经胆道排出。人胆汁中可见高浓度的阿奇霉素及10种代谢物。比较组织的HPLC及微生物含量测定的结果，发现代谢产物不具有抗菌活性。特殊人群的药代动力学[u]老年[/u]老年健康志愿者(]65岁)服药5天后发现其AUC略高于青年健康志愿者([40岁)，但尚不明确这种差异的显著临床意义，因此不推荐调整剂量。[u]肾功能受损[/u]轻、中度肾功能不全（肾小球滤过率为10-80ml/min）患者口服阿奇霉素单剂1g后，其药代动力学无明显变化。严重肾功能不全（肾小球滤过率[10ml/min）患者的药代动力学参数与肾功能正常者相比有统计学上的显著差异，其药时曲线下面积（0 到120小时）分别为8.8μg·h/ml和11.7μg·h/ml，峰浓度分别为1.0μg/ml和1.6μg/ml，肾清除率分别为 2.3ml/min/kg和0.2ml/min/kg。[u]肝功能受损[/u]轻度（A级）和中度（B级）肝功能不全患者，其血浆药代动力学与肝功能正常者无明显区别，但这些患者尿中阿奇霉素回收率明显增加，这可能与代偿有关。
