交通运输管理局是否有权扣车根据情况来定。
非营运车辆如果擅自从事道路运输经营，道路运输管理局就有权扣车，否则无权扣车。根据规定货运经营者不得运输法律、行政法规禁止运输的货物。法律、行政法规规定必须办理有关手续后方可运输的货物，货运经营者应当查验有关手续。运输危险货物应当配备必要的押运人员，保证危险货物处于押运人员的监管之下，并悬挂明显的危险货物运输标志。运管扣车的必要证据需车辆没有运营手续、私自经营、车辆不符合条件、不具备从业资格，只有具备经营资质和运营条件的企业、人员、车辆才有权从事道路客运。如果符合其他地方性法规规定的违法行为，被路政执法人员查获，应当扣车罚款。
【法律依据】
《中华人民共和国道路交通安全法》
第九十条机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。