李自成的失败归结起来，主要是其内在原因造成的。 一、起义军主要领导人缺乏知识。主要领导人包括李自成、张献中、刘宗敏等。他们的主要问题： 一是缺乏历史知识，不懂得前人成功的经验与失败的教训，不知道怎样巩固胜利的成果。李自成所领导的农民起义，除了起义本身所具有的一点点进步的性质之外，别无任何可取的进步政策。他们是一些典型的“史盲”。 二是缺乏文化知识，是比较典型的“文盲”。这表现在他们注重使用武将、排斥文人墨客等方面。特别是对待故明有学识的官僚，不分良莠，几乎一概排斥、弃置不用。身边没有能帮助承前启后治国安邦的人，自己又不善于学习，而文盲是根本不可能治理好国家的，尤其在明朝社会文化基础较好的历史条件下。 三是缺乏知人善任的内政措施，堪称“政盲”。事实上，李自成能够取得推翻明朝的胜利，在很大程度上有赖于官僚子弟李信（后来改名为李岩）的精心谋划以及红娘子等一些智勇双全之辈们的鼎立相助，否则，将难以取胜。然而，在推翻明朝皇帝取得初步胜利后（当时全国尚有大片土地还在明朝的其他统治者手中，故而只能算初步胜利），却将唯一颇有治国才能的李信杀害，由此造成起义军的分裂。李自成所信任的牛金星（被李自成封为丞相）、刘宗敏（李自成手下大将）等人，不是势力奸诈小人，就是重财好色的“莽夫”。例如，如果不是刘宗敏好色而掠占了吴三桂的爱妾陈媛媛，吴三桂就不可能投降清军并引领清军进入天下第一关（山海关）；如果不用牛金星，就不会有李信的被杀及张献中的分裂。这些重大问题的发生无不与李自成缺乏知人善任的本领有关。他是非颠倒、黑白不分，以致酿成了自饮的苦酒。 四是缺乏战略知识，属于“军盲”。主要表现在，对军队没有一套严格的纪律规定，这是其一；其二是对清军没有任何防范，清军一入关，即卷席而西逃；其三是对明朝部属、军队、官吏没有完全讨平。实际上，即使清军不来，故明旧部也完全能够将李自成的起义军打败，或者驱逐其出京城。这是很容易的事情。 二、起义军内部争权夺利，闹不团结搞分裂。其中，大的分裂发生在李自成与张献中两股军事集团之间。张献中自以为革命资格比较老（他同高迎祥共同起义，后来高迎祥提拔了李自成），不愿服从李自成的调遣，自己带领一股人马跑到四川“占山为王”。李自成也根本不把张献中放在眼里。两股军事力量互不理睬、正可谓老死不相往来。这样，在清军入关南下对李自成穷追猛打、万分危机的情况下，张献中仍然不予帮助、置之不理。李自成则单打独斗。结果，让清军先吃掉了李、随后吞食了张。此外，李自成内部的分裂发生在牛金星一派与李信和红娘子一派之间、刘宗敏一派与其他部将各派之间。牛金星唆使李自成错误地杀害了众望所归的李信，这是起义军莫大的损失。刘宗敏也为争夺权色，与李自成暗中较劲，蓄意捣乱。在这些将领们的授意指示下，占领京都的起义军将不似将、兵不似兵，由无所作为导致肆意妄为，扰乱和残害百姓，制造了多方面混乱，失去了民心和政权的基础。
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