大区机构，1997年后入驻西南的大多都在重庆：
西南反垄断局，为国家派出西南机构。对重庆，四川，云南，贵州，西藏进行反垄断调查。
西南兵工局。下属重庆，四川，贵州，云南等多家兵工企业。
中国城市规划设计院西部分院位于重庆
中国海事仲裁委员会西南分会，位于重庆
中国经贸仲裁委员会西南分会，位于重庆
中国人民银行重庆营业管理部（和北京一样，直属中央）
在新一轮的大区机构设置里，重庆的机构多为经贸、海关、金融
除了以上还有
中科院软件研究所、中国科学院绿色智能技术研究院、
工信部电信研究院西部分院、工信部国家软件公共服务平台西部平台、商务部中国国际电子商务中心（CIECC）西南
云计算数据中心、人力资源和社会保障部西区数据信息集成中心、科技部西南信息中心、交通部交通运输信息通信技术西南研究院、交通部全国数据处理中心，交通部交通运输通信信息工程质量检测中心西部分中心、民航局西南数据中心、国家知识产权局“云计算专利数据库服务平台” 中心、
北斗卫星西南运营中心、 中国并购公会西南分会、中国国际经济贸易仲裁委员会西南分会、中国西部金融仲裁院、重庆
OTC交易中心、中国人民银行综合服务基地、国家知识产权局专利局专利审查协作预警咨询中心西部办事处、中国城市规划设计院西部分院、中国海事仲裁委员会西南分会、西南兵工局（
中国兵器装备集团公司西南地区部）、中国国家国际电子商务交易认证中心、科技部国家海上风电工程技术研究中心、科技部国家海上风电工程技术研究中心学委会 、西南地区灾备指挥后勤物资保障中心、国家知识产权局西南区域专利信息中心、中铁电气化局西南总部、国家人口计生委西南人口信息中心、中国农机院西南产业基地、中国海关总署全国海关安全报关中心研发中心、西南反垄断调查局、中国海关总署西部海关化验中心、国家质检总局西南国家质检中心、国家司法鉴定机构西部鉴定中心、 中国策划研究院西南分院、总装备部重庆军事代表局、海军装备部驻重庆地区军事代表局、第二炮兵装备部驻重庆地区军事代表局、总后勤部驻重庆代表处、中国人民银行重庆营管部