一、两者的职责不同：
1、工程管理部的职责：不仅受到工程理念、决策设计、构建、组织运行等过程的支配也关联到资源、材料、资金人力土地、环境和信息等要素的合理配置。
2、项目部的职责：指实施或参与项目管理工作，且有明确的职责、权限和相互关系的人员及设施的集合。包括发包人、承包人、分包人和其他有关单位为完成项目管理目标而建立的管理组织。
二、两者的相关要求不同：
1、工程管理部的相关要求：制定并组织施工技术、质量、职业健康安全、环境保护等措施的贯彻实施，经常深入施工现场，检查指导施工工作，组织安全大检查、质量检查以及分部工程质量检查工作。负责按规定及时向业主、监理工程师报送有关报表和资料。
2、项目部的相关要求：维护本项目部利益，热爱本职工作，遵守项目管理制度，牢固树立主人翁意识；对工作区域必须定期整理，保持整洁、文明、卫生的工作环境；值班时间不得溜班，不得追逐打闹，不得无故缺勤。
三、两者的管理措施不同：
1、工程管理部的管理措施：
（1）严格执行以项目部为核心的质量“三检制”（班组自检、作业队复检、项目部终检），提高一次验收合格率。
（2）项目部质检人员应对隐蔽工程和关键部位进行跟班旁站检查。
（3）项目部对分包工程实施有效监控，严禁“以包代管”。
（4）坚持审图和工艺设计，编制技术措施，为施工质量提供技术保证。
（5）严格执行规程规范，严格施工工艺。
2、项目部的管理措施：
（1）项目部全面履行工程施工的质量、安全、进度、文明施工责任，对业主和法人负责，作业层对项目部负责。
（2）项目经理是本工程质量第一责任人，对工程质量负终身责任。
（3）项目部建立质量保证体系，全面执行公司质量体系程序文件，编制质量计划，配备足够的持证专职质量管理人员，确保工程项目质量满足合同要求，创优质工程。
参考资料来源：百度百科-项目部
参考资料来源：百度百科-工程管理
项目的工程管理部负责项目部负责标段内部的施工生产进度等，一般包含领工员，调度员，电工，地亩员等；
也有的项目的工程管理部是个大部，包含技术，质检（或者单独成立质检部，或者单独成立安全质量部），调度，计价（或者单独成立合同预算部），领工，电工，地亩员等等。
项目部（也称项目经理部，也有称项目指挥部的）是公司派出的负责一个具体项目实施的管理机构，项目经理是该机构的负责人，上对公司总经理负责。项目部全面负责项目生产进度、资源、协调、成本、技术、质量、安全、环保等一切相关实施工作。本回答被提问者采纳