员工自离，办理好离职交接手续后即解除了劳动关系。
劳动者解除劳动合同，应当提前三十日以书面形式通知用人单位。
有下列情形之一的，劳动者可以随时通知用人单位解除劳动合同：
(一)在试用期内的
(二)用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动的;
(三)用人单位未按照劳动合同约定支付劳动报酬或者提供劳动条件的。
自动离职，员工由于自身的原因没有通知单位主动离职，在没有办理正式的离职手续就强行解除与单位的劳动关系离开单位。
但是劳动法律法规并不存在自动离职或是自动解除劳动合同的说法。
员工“自动离职”后，在劳资双方均没有明确书面表示辞职或辞退的情况下，劳动合同其实并未解除，单位仍应对劳动者承担某些劳动法上的义务。
只有当单位解除或者终止、员工解除、协商解除三种情况，劳动关才会终止。
对于那些擅自离职的，单位有权按照法定程序解除或者终止劳动关系，一般按照旷工流程处理。
第一，制定有完善的公司规章制度，包括对旷工的定义、旷工的处理，其中须制定有旷工几天视为严重违反公司规章制度可解除劳动合同的内容。
第二，向离职员工邮寄送达一份《返岗通知》，催告其准时准点返回公司上班，告知其如有特殊情况，需履提交相应请假手续，告知逾期不返岗的法律后果。
第三，如员工收到《返岗通知》拒不返岗的或者催告后员工没有在通知规定时间内返岗，可依据企业规章制度的规定，书面通知员工解除双方劳动合同。以上书面通知，都需要注意通知的书面证据保留，一定要采取EMS寄送通知的方式。
第四、因为自离给单位造成经济损失，单位可以追究该劳动者的赔偿责任。
法律依据：
《劳动法》
第三十一条劳动者解除劳动合同，应当提前三十日以书面形式通知用人单位。
《中华人民共和国劳动合同法》
第三十九条劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
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