（一）职责分工。卫生部会同教育部负责监测工作的领导和协调，成立全国农村义务教育学生营养改善计划营养与健康状况监测评估专家组，制定监测评估工作方案，定期组织检查、督导和评估。中国疾病预防控制中心营养与食品安全所（以下简称中国疾控中心营养所）负责提供技术支持，制定监测评估技术方案，培训省级监测骨干人员，建立数据库，汇总、分析全国数据，完成全国农村义务教育学生营养改善监测评估报告。
省级卫生行政部门会同教育行政部门负责本省份监测工作的组织管理。根据工作方案要求制定本省份实施方案，开展督导检查和考核，向省级农村义务教育学生营养改善计划领导小组和卫生部提交监测评估工作报告。省、地市级疾控中心负责制定本省份、本地市监测技术方案，提供技术指导、质量控制、督导及现场工作人员培训，对数据进行审核、分析，撰写技术报告。
县级卫生行政部门会同教育行政部门根据监测方案，组织疾病预防控制中心和监测学校，具体实施本地学生营养监测评估工作，形成监测报告报县级农村义务教育学生营养改善计划领导小组和上级主管部门。县级疾病预防控制中心负责实施重点监测，指导学校开展常规监测，负责数据收集、录入，综合分析后及时上报监测结果，规范管理监测资料。监测点学校由校长及有关人员组成工作组，配合完成本校的监测任务。
（二）数据上报与审核。建立学生营养监测数据管理系统，常规监测数据实行统计报表（食堂供餐和学生因病缺课情况每月上报，其余指标每年4月上报）直接报告制。常规监测学校将监测报表报县级疾病预防控制中心。县级疾控中心在地市级疾控中心指导支持下，对数据进行整理录入，将监测基础数据分别于每月20日和每年4月底前报省级疾控中心和中国疾控中心营养所，重点监测信息每年6月底前报省级疾控中心和中国疾控中心营养所。
省级疾病预防控制中心负责对上报的监测信息进行及时审核，并及时反馈至监测县，网络直报实行省级终审责任制。中国疾控中心营养所适时掌握监测直报进展，组织各省进行年度数据集中审核。
（三）报告形成。省级卫生行政部门负责汇总本地工作情况，结合省级疾病预防控制中心提交的技术报告，形成年度工作报告，每年9月底前报卫生部和省级农村义务教育学生营养改善计划领导小组。中国疾控中心营养所汇总各省份工作报告及监测数据后形成国家级监测评估报告，于11月中旬前报卫生部和全国农村义务教育学生营养改善计划领导小组。
（四）资料管理。农村学生营养改善监测资料属于农村学生营养改善工作的一部分，监测工作具体实施部门和个人未经主管卫生行政部门许可，不得擅自公布或发表监测信息资料。原始资料归档保存在县级疾病预防控制中心备查。各级执行机构详尽记录项目内容和进度并建立档案。内容包括经费下拨与使用、培训、监测进度及监测结果、组织管理和技术督导等与项目有关的全部文件和技术资料。
（五）工作队伍。地方各级卫生行政部门指定专人，加强监测工作的管理。省、地市级疾病预防控制机构加强营养科室建设，县级卫生部门牵头组织，教育等部门配合，共同组建监测队，紧密结合学生体检、学生体质健康标准、学期考试等，开展各项具体工作。
（六）资金安排。按照《农村义务教育学生营养改善计划实施细则》有关规定，合理安排各级农村义务教育学生营养改善计划营养健康状况监测评估工作资金，确保各项工作落到实处。
