汉语拼音能同时做两件事，汉字罗马化和汉语注音，威妥玛拼音只能做一件，即汉字罗马化。汉语注音部分，汉语拼音近乎完美的复制了注音符号的功能，所以，考虑汉语拼音具有两种功能，威妥玛拼音只有一种，汉语拼音已经赢在起跑线了，不过，这里先不管注音，这里就单说汉字罗马化的部分。汉语拼音和威妥玛拼音的差异主要有以下几点，并且我会说明这种差异的所带来的各自的优缺点： 1. 送气/不送气音的处理汉语中并没有浊音，只有送气清音（p，t，k等）和不送气清音（b，d，g等），威妥玛拼音用送气符 ' 来区分送气音和不送气音，比如pao（包），p'ao（抛），这种做法是符合欧陆语言对清浊音的执着的，用一个'表示送气，也是欧洲人的常识（另一种送气标志是类似国际音标那样加个h，比如Thailand）。而汉语拼音呢（包括陈水扁时代台湾弄出来的通用拼音），用英语中的请浊音来指示汉语的中的送气和不送气音，比如bao（包）和pao（抛），汉语拼音的逻辑就是，中国人（这里指汉语母语者，下同），对送气不送气音的区分远大于清浊音，那就借用拉丁语系的浊音来表示不送气清音就好。这种做法比较符合中国人的直觉，和威妥玛拼音相比，一个方便中国人，一个方便欧洲人，并没有高下之分。但是呢，现代美式英语有浊音清化的趋势（相比美音，大量的重度浊音会让英音或者欧陆语言听起来很低沉），加之美国人对送气音不送气音也没什么区分度，比如sport，中国人觉得那个p是清音浊化（很多老师都是这么教的，全错），其实对美国人来说，就是偷懒，已经送过气的s后面的p不再送气，中国人在这点上耳朵很灵敏，听起来就是两个完全不同的音位，美国人觉得根本没差。另一方面，送气符'算是特殊符号，在全字母传播时很容易被丢掉，比如台湾的县级地名，Taiwan，Taipei，Taichung等，都是威妥玛拼音，正确的拼法是T'aiwan，T'aipei，T'aichung，但是送气符现在已经很少有人写了，比如Taipei，按美式英语习惯，那就是『台沛』，大部分外国人都是这么念的，但依照威妥玛拼音呢，Taipei其实是『呆北』，怎么念都是错的。值得一提的，碰过几个法国人，会把Taipei念成『呆北』，没被美式英语洗脑的人真好o(╯□╰)o。送气符丢失的另一个麻烦，就是人名地名的重码率大增，比如面对台湾人名的罗马转写，chang是张还是常？cheng是郑还是成？根本没法区分。基于以上几个原因，在数字化传播和美式英语横扫世界的今天，汉语拼音的处理方式全方位胜过威妥玛拼音。
对 『j q x』等的处理这是汉语拼音被人诟病最多的地方，外国人面对j q x（还有zh，c）基本是一脸茫然。然而，一个没经过中文训练的美国人，让他正确发出『鸡』『七』『西』，几乎是不可能的，这几个音是迁就外国人（主要是英语系人士），还是坚持正确的中文读音？显然，威妥玛拼音是英国人发明的，他选择了前者，而汉语拼音是中国人发明的，他选择了后者，两者的思路并没有高下之分。但是，威妥玛拼音的不妥之处，在于『j，zh』两个声母都选择了用ch来拼写，再加上上文提到的送气符丢失，一下子『j，q，zh，ch』四个声母都变成了『ch』，重码率非常非常高，你可以发现，台湾人名的缩写，一大堆C. C. C.，到底是这四个声母的哪一个？who knows汉语拼音到底为何选择了j，q，x，c，有人考据过是来自于葡萄牙语、古典拉丁语等，不过，这不重要，现在英语是主流，这几个音让英语系人士困惑确实是事实。但是，在英语的外来语中，『遵从主人』也是一个基本原则，比如那个做奢侈品的Chanel，如果一个美国人按英语规则念『拆闹』，那只会被人笑没文化，这词来自法语，美国人必须去了解法语的发音习惯，再比如，美国城市San Jose，美国人如果念成『三皱斯』，那就和看字念半边的中国人一样可笑，这词来自于西班牙语，必须尊重西语的规则念『三猴塞』。所以，可以想象，当使用汉语拼音的华人华侨 在英语世界越来越多的时候，英语系人士也会去学习汉语拼音的规则。
韵母声母的一致性问题这点也是汉语拼音胜出威妥玛拼音的地方。刚才提到，威妥玛拼音会出现『多音一拼』的现象，其实，威妥玛拼音还有一些『一音多拼』的问题，比如『紫』是『tzu』，『组』又是『tsu』；『思』是『ssi』，『苏』又是『su』，当然，这里也有规则可循，这几个声母在空韵前面的拼法会不一样，但是无疑会搞得整个拼音方案很复杂。另外，威妥玛拼音还有一些韵母不一致的现象，比如『e』在不同声母后有『e』和『o』，『ui』会变成『ui』和『uei』等。总之，整个威妥玛系统各种一对多，多对一，以英国发明人的视角看，或许有道理，但是相比几乎一一对应于注音符号的汉语拼音，这个系统太繁琐了，君不见台湾人新办护照都要现查罗马转写，Yahoo知识+里一堆这种问题，如果今天百度知道有人问怎么拼写护照名，只会被人嘲笑幼儿园没毕业吧。
