单位办理个人所得税汇算清缴的流程：
单位集中办理个税综合所得汇算清缴,需要授权给财务人员权限，通过登录自然人电子税务局网页版进行集中申报，具体操作流程如下：
一.授权给财务人员（已做过实名办税的财务人员不需要再次授权）。
方式一：企业法人/财务负责人登录【个人所得税app】-【个人中心】-【企业办税权限】-【新增授权人员】。
方式二：企业法人/财务负责人登录【自然人电子税务局（网页版）】-【完善个人信息】-【办税权限管理】-【点击详情】-【新增授权人员】。
登录自然人电子税务局（网页版）进行申报，
第一步：经授权的财务人员，登录【自然人电子税务局（网页版）】选择对应汇缴的单位，可以输入该单位省和市和税号来搜索再点击【立即申报】。
注意事项：集中办理汇缴不支持逾期办理。扣缴义务人为纳税人办理汇算清缴，应在6月30日前代为填报相关表单以及办理后续的补退税等相关事项。
第二步：报表填写报送—可直接添加或用模板导入，核对数据无误后点击【报送】。
第三步：退税申请—退税状态为【待退税】和【放弃退税】的可以提交退税申请。
第四步：税款缴纳—申报表报送成功后，存在欠税的，可点击【税款缴纳】办理缴税业务。
第五步：申报查询—点击【申报记录查询】可查询已申报数据。