无功功率自动补偿控制器上显示负数的原因可能有以下几种情况：
控制器的测量和计算误差：控制器可能存在测量误差或计算误差，导致显示的数值为负数。这可能是由于传感器的精度问题、电路元件的老化或损坏等原因引起的。
电网电压异常：当电网电压异常时，例如电压波动较大或电压失调，控制器可能会显示负数。这是因为无功功率是电压和电流的乘积，当电压异常时，计算结果可能会出现负数。
电力系统的无功功率产生和吸收：在电力系统中，无功功率可以由负载产生或吸收。当负载产生的无功功率大于吸收的无功功率时，控制器可能会显示负数。
控制器配置错误：控制器的配置可能存在错误，例如误将功率因数的正负号设置错误，导致显示的数值为负数。
为了确定具体原因，建议检查控制器的测量和计算部分是否正常工作，检查电网电压是否正常，以及检查控制器的配置是否正确。如果仍然无法确定原因，可能需要进一步的故障排除或专业人员的帮助。