dna 序列测出来之后怎么确定菌属啊 有么有高手指点一下,本人不是这个专业的 不懂啊 qq396821413

如题所述

你不是全基因组测序吧,一般做分子鉴定的,都是部分序列才对。对于细菌啊放线菌啊等原核生物,一般测的都是16S rDNA,对于真菌一般18S和ITS的都有。一般你拿到序列后去NCBI上blast同源序列,然后用这些序列下载下来用Clustal X进行序列比对分析,然后把分析结果改成fas格式,最后用mega做出进化树一般就可以确定到属了。不过如果你只是要看是哪个属,并不要发文章的话,一般直接在NCBI用blast,输入你的序列后,然后自己比对下Blast结果中绝大部分菌的属,就可以确定你那个菌是这个属的了。当然,无论细菌的16s还是真菌的ITS或者18S基因序列,其实都不能鉴定到种,如果你要鉴定到种的话,还要进行形态学分析和生化指标分析的。
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