北京藏医院心脑血管内科作为国家中医药管理局十五期间的重点建设项目，自2002年成立以来，凭借深厚的藏医文化底蕴和丰富的临床经验，在心脑血管疾病治疗领域独具特色。藏医药理论体系中，对脑血管疾病和心血管疾病有着独特的见解，如将出血性脑血管病称为“脑血瘫”，缺血性脑血管病称为“脑脉瘫”，心绞痛称为“心痛病”。其治疗理念强调“血”、“隆”（类似中医的“气”）和“脉”的结合，采用藏成药如七十味珍珠丸、珊瑚丸等进行综合辨证治疗，通过补“隆”养“血”、降“隆”调“脉”等方法，旨在改善脑供血、滋养神经并抑制脑细胞死亡，达到标本兼治的效果。
科室采用内服纯藏药结合藏药浴、金（银）针、火灸、放血等传统藏式疗法，与现代康复技术相结合，至今已接待了包括高血压、心绞痛、脑血栓、脑出血等多种心脑血管疾病的患者，治疗有效率超过86%。为了提升医疗服务质量，科室与中日友好医院、安贞医院等单位紧密合作，交流学术资源，挖掘和整理藏医大师的临床经验和秘方，以及民间的实用诊疗方法。已发表多篇论文，如《补隆养血和降隆吸血法对治疗脑中风后遗症的疗效观察》等，并编写了《藏药方剂大全》和《藏医脑血管疾病诊断与治疗学》等专业书籍。目前，他们正致力于《藏医民间医技医法抢救与整理》的工作，以进一步传承和发扬藏医精髓。
北京藏医院暨北京民族医院是北京地区唯一一所国家级民族医院。它的前身是北京藏医院，成立于1992年，1998年由国家投资易地进行了扩建，并冠名北京民族医院暨北京藏医院。目前新址坐落在亚运村安外小关北里218号，占地面积22亩，一期建筑面积近12000 平方米，是“以藏医为主，多民族医为一体，集医疗、科研、教学和康复相结合”的特色医院。