概括说来，新疆地貌具有以下特点。
一、山系走向与深大断裂方向一致
阿尔泰山受额尔齐斯大断裂控制，作北西至南东走向;准噶尔西部地区和阿尔金山的走向，分别与达拉布特断裂控制和阿尔金断裂方向一致;天山作北西西—南东东或北东东—南西西走向，这均是同方向断裂控制的结果。由于断裂控制山系，山地又夹持盆地，因此，构成了三角形的准噶尔盆地和不规则菱形的塔里木盆地。
二、山地与盆地高差悬殊大
构造运动使山地强烈上升，盆地下陷。据统计:阿尔泰山平均海拔为2500～3500m，最高峰(友谊峰)在4374m;天山平均海拔为4000～5000m，最高峰(托木尔峰)达7435m;昆仑山平均海拔为4500～5000m，帕米尔高原公格尔峰与昆仑山乔戈里峰分别为7719m和8611m，最高峰(乔戈里峰)达8611m。山脉夹持的准噶尔盆地与塔里木盆地的海拔分别为300～500m和800～1000m，山地与盆地高差分别为2200～4000与2700～4000m余。塔里木盆地与周边山地的山盆高差达3000～7200m;吐鲁番盆地的艾丁湖面低于海平面154.31m，与相邻博格达峰(5445m)高差达5599.31m。
三、山间盆地多
在山体强烈隆起的同时其内部断裂发育，断块差异升降形成了如阿尔泰山的青河盆地、可可托海盆地与吐尔洪盆地，天山的巴里坤盆地、吐鲁番-哈密盆地、焉耆盆地、尤尔都斯盆地和伊犁盆地，昆仑山的库木库勒盆地、阿什库勒盆地等33个盆地或谷地，面积达12602.2km2。盆地沉降中心，大多积水形成如巴里坤盆地内的巴里坤湖，焉耆盆地内的博斯腾湖，尤尔斯盆地内的天鹅湖，库木库勒盆地内的阿雅格库木湖和阿其克库勒湖等。
四、山地层状地貌明显
山地由于受断裂与断块不等量抬升及剥夷作用，形成了阿尔泰山的5级梯级面(海拔分别为3200～3500m，3000～2600m，2400～2000m，1400～1100m，800m左右)，天山的3级(海拔分别为1800～2200m，2800～3200m，4000m以上)。昆仑山也有2～3级梯级地形。
五、沙漠面积大
塔克拉玛干沙漠是世界第二大流动沙漠;古尔班通古特沙漠是我国著名的半固定沙漠。此外，伊犁、吐鲁番、焉耆、尤尔都斯、巴里坤和库木库勒盆地与布伦口湖岸等地均有沙漠分布，沙漠面积达42.48×104km2，占新疆总面积的25.86%。
六、地貌外力作用类型组合呈环状结构
塔里木和准噶尔盆地均为山地环绕，平原区砂粒物质经风蚀风积作用，形成风蚀平原或沙丘、沙山;山地受纬度和海拔高低、阴坡和阳坡、迎风坡与背风坡及其温度、降水及干燥度差异的影响，地貌外力作用类型的海拔与空间分布自北向南，自西向东不尽一致;山地局部地方还有黄土覆盖等。在天山北坡，地貌类型组合规律自盆地向山地一般是:盆地低洼处潴水形成湖泊，自湖泊向外依次为湖积平原→湖积冲积平原→冲积平原→冲洪积平原→洪积平原→干燥作用丘陵→干燥作用或半干燥作用低山→流水侵蚀中山→冰缘作用高山→冰川作用高山或极高山。总体上自盆地腹部向高山呈现出为风沙作用沙漠→冲积、洪积平原→干燥作用丘陵、低山→半干燥作用或流水作用中山→冰川、冰缘作用高山的环状结构。