《就业协议书》与《劳动合同》的区别有主体不同、内容不同、时间不同、适用法律不同。
1、主体不同。
《就业协议书》，是由教育部高校学生司统一制定的，为高校应届毕业生在就业过程中签订就业协议的一种书面合同。毕业生就业协议书的签证部门是各级县、市人事调配部门。
《劳动合同》，是指劳动者同企业、事业等用人单位确立劳动关系，明确双方权利和义务的协议。
2、内容不同。
《就业协议书》内容主要体现毕业生情况和意见、用人单位情况和意见及学校意见，其协议约定仅指学生在毕业后到用人单位去工作的一份书面合同。劳动合同的签证机关是各级劳动行政部门。
《劳动合同》是依据《劳动法》规定以书面形式订立，其中载明合同的期限、工作内容、劳动保护和劳动条件、劳动报酬、劳动纪律、合同终止等条款，对双方当事人具有法律约束力。
3、时间不同。
《就业协议书》签订在前，自签订之日起至毕业生到单位报到，用人单位正式接收后自行终止。
《劳动合同》签订在后。由毕业生和用人单位协商签订期限。
4、适用法律不同。
《就业协议书》仅仅是确立了毕业生和用人单位之间劳动关系，劳动合同更进一步确立了双方的权利和义务。《就业协议书》性质是普通民事协议，适用《民法通则》、《合同法》，并且非强制性签订，签订了《就业协议》任一方都不得随意解除，否则承担赔偿违约金的责任。
《劳动合同》毕业生从事何种岗位、享受何种待遇等权利和义务的依据。而劳动合同适用《劳动法》、《劳动合同法》、《劳动争议调解仲裁法》等法律法规。
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