合作医疗能退，退费的流程如下：
1、写一份申请告并知道错交的具体原因，情况必须属实；
2、有关部门就会将交错的款项退回当事人的银行卡里。
新农合平时无法缴费，只能在年底统一开展筹资工作时才能缴费。新型农村合作医疗是按年度缴费和享受待遇的，当年的12月31日前办理下一个年度的参保和缴费。待遇是从参保缴费的下一年度的1月1日开始享受。新农合每年10月中旬开始筹资，第二年1月1日开始生效，享受报销。
新型农村合作医疗报销范围是，参加人员在统筹期内因病在定点医院住院诊治所产生的药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合城镇职工医疗保险报销范围的部分（即有效医药费用）。
新型农村合作医疗基金支付设立起付标准和最高支付限额。医院年起付标准以下的住院费用由个人自付。同一统筹期内达到起付标准的，住院两次及两次以上所产生的住院费用可累计报销。超过起付标准的住院费用实行分段计算，累加报销，每人每年累计报销有最高限额。
综上所述，新型农村合作医疗报销程序是，参保者出院后，将经患者本人签字或盖章的住院发票、出院记录、费用清单、转诊证明及本人身份证复印件或户籍证明缴本乡镇合管所，经审核后集中统一送交市农保业务管理中心。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》第二十四条
国家建立和完善新型农村合作医疗制度。
新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。
第三十条
下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：
（一）应当从工伤保险基金中支付的；
（二）应当由第三人负担的；
（三）应当由公共卫生负担的；
（四）在境外就医的。
医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。
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