是公务员编制。
中华人民共和国南京海事局是中华人民共和国江苏海事局的分支机构，属于政府部门。
《公务员范围规定》第六条规定，各级行政机关中列入公务员范围的人员：
（一）各级人民政府的领导人员；
（二）县级以上各级人民政府工作部门和派出机构的工作人员；
（三）乡、镇人民政府机关的工作人员。
综上所述，南京海事局的工作人员属于公务员编制。
扩展资料：
《公务员范围规定》
第二条列入公务员范围的工作人员必须同时符合下列条件：
（一）依法履行公职；
（二）纳入国家行政编制；
（三）由国家财政负担工资福利。
第三条下列机关中除工勤人员以外的工作人员列入公务员范围：
（一）中国共产党各级机关；
（二）各级人民代表大会及其常务委员会机关；
（三）各级行政机关；
（四）中国人民政治协商会议各级委员会机关；
（五）各级审判机关；
（六）各级检察机关；
（七）各民主党派和工商联的各级机关。
参考资料来源：
参考资料来源：