职级不同，服务对象不同，发展前景也有所不同，两者相比县委办要更有前途一些。
县委办级别为正科级，县政府办是县政府的组成部门，级别也为正科级，尽管说部门职级一样，但是部门领导的级别却有着非常大的区别，一般来说县委办主任要进入县委常委，级别是副处级，不仅要负责县委办日常工作，而且是常委，县政府办领导责任只是正科级，因此两者在职级上来说也有很大的区别。
县委办公室机构设置：文秘组、综合组、县委督查室、县委保密委员会办公室（县国家保密局）、政研信息室、后勤组、县委机要室
县政府办公室机构设置：行政科、秘书科、督办科、法制科、信息科、办事处
法律依据：
《地方各级人民政府机构设置和编制管理条例》
第九条地方各级人民政府行政机构的设立、撤销、合并或者变更规格、名称，由本级人民政府提出方案，经上一级人民政府机构编制管理机关审核后，报上一级人民政府批准；其中，县级以上地方各级人民政府行政机构的设立、撤销或者合并，还应当依法报本级人民代表大会常务委员会备案。
第十条地方各级人民政府行政机构职责相同或者相近的，原则上由一个行政机构承担。行政机构之间对职责划分有异议的，应当主动协商解决。协商一致的，报本级人民政府机构编制管理机关备案；协商不一致的，应当提请本级人民政府机构编制管理机关提出协调意见，由机构编制管理机关报本级人民政府决定。
第十一条地方各级人民政府设立议事协调机构，应当严格控制；可以交由现有机构承担职能的或者由现有机构进行协调可以解决问题的，不另设立议事协调机构。为办理一定时期内某项特定工作设立的议事协调机构，应当明确规定其撤销的条件和期限。
第十二条县级以上地方各级人民政府的议事协调机构不单独设立办事机构，具体工作由有关的行政机构承担。
第十三条地方各级人民政府行政机构根据工作需要和精干的原则，设立必要的内设机构。县级以上地方各级人民政府行政机构的内设机构的设立、撤销、合并或者变更规格、名称，由该行政机构报本级人民政府机构编制管理机关审批。
