二十四功臣的座次排序考虑很多因素，主要顺序应当是官阶决定，次要顺序是这些功臣在太宗心中的地位。由于二十四功臣像是在贞观十七年列入凌烟阁，所以排位顺序按照当时的官阶，逝世者按其死后追赠官阶。
其顺序为：（带下划线的表示贞观十七年前去世）
一品：
▪ 赵国公 长孙无忌：司徒（正一品）、赵国公
▪ 河间郡王 李孝恭： 河间郡王（正一品）、赠司空（正一品）、扬州都督（从二品）
追赠一品:
▪ 莱国公 杜如晦：尚书右仆射（从二品）、赠司空（正一品）、莱国公
▪ 郑国公 魏征： 太子太师（从一品）、赠司空（正一品）、相州都督（从三品）、郑国公
二品：
▪ 梁国公 房玄龄：尚书左仆射（从二品）、魏国公，后改梁国公
▪ 申国公 高士廉：尚书右仆射（从二品）、开府仪同三司（从一品）、申国公
▪ 鄂国公 尉迟敬德：开府仪同三司（从一品）、鄂国公
▪ 卫国公 李靖：尚书右仆射（从二品）、特进（正二品）、卫国公
▪ 宋国公 萧瑀：特进（正二品）、宋国公 （萧瑀多次升迁，找不到具体官职，但是他做过中书令正三品）
追赠二品：
▪ 褒国公 段志玄：褒国公、赠辅国大将军（正二品）、扬州都督（从二品）
二品：
▪ 夔国公 刘弘基：辅国大将军（正二品）、夔国公
▪ 蒋国公 屈突通：左光禄大夫（高祖时从一品，太宗十二年改从二品）、蒋国公、赠尚书左仆射（从二品）
追赠二品
▪ 勋国公 殷峤：郧国公、赠陕东道行台右仆射（从二品）、司空（正一品）、
二品：
▪ 谯国公 柴绍：镇军大将军（从二品）、赠荆州都督（从三品）、谯国公
三品：
▪ 邳国公 长孙顺德：左骁卫大将军（正三品）、邳国公、赠荆州都督（从三品）、开府仪同三司（从一品）
▪ 郧国公 张亮：工部尚书（正三品）、洛州都督（从三品）、郧国公
▪ 陈国公 侯君集：吏部尚书（正三品）、陈国公
▪ 郯国公 张公谨：郯国公、赠左骁卫大将军（正三品）
▪ 卢国公 程知节：左领军大将军（正三品）、卢国公
▪ 永兴县公 虞世南：永兴县子、赠礼部尚书（正三品）
▪ 渝国公 刘政会：赠民部尚书（正三品）、追改渝国公
▪ 莒国公 唐俭：光禄大夫（从二品）、民部尚书（正三品）、莒国公
▪ 英国公 李绩：光禄大夫（从二品）、兵部尚书（正三品）、英国公
▪ 胡国公 秦琼：左武卫大将军（正三品）、赠徐州都督（从三品）、胡国公
①其中排序主要按照其职事官位的高低，然后相同情况下以左为尊，比如左右仆射。
②逝世者排在在世者前面，先逝世的排在后逝世的前面。
③六部顺序：初，礼部次吏部，兵部次之，民部次之。贞观年改以民部次礼部，兵部次之。则天初又改以户部次吏部，礼部次之，兵部次之。
——数据来源《旧唐书》，官阶品级来源——《旧唐书 志第二十二 职官一》
在各自的品级里面，影响排名的主要有两个因素：
①对李唐立下的功劳的高低
②是不是参与玄武门之变
参与策划与执行玄武门之变的人，在太宗心中分量都会比较高，比如长孙无忌、房玄龄、杜如晦、尉迟敬德，因此排名较高。
其次就是为李唐建立的功劳，比如河间郡王李孝恭、李靖等。
关于次序的几个补充（欢迎提问）：
一、
对于秦琼，为什么名列二十四功臣末，很多论坛包括知乎都有很多的讨论，其中最主流的看法是秦琼没有参与“玄武门之变”，或者说他只是表明了立场，但是没有抵达现场。因此《旧唐书》中没有直接写他参与玄武门事变，而是写到，从诛建成、元吉。从李世民登记后封赏大臣也可看出，
比如封赏尉迟恭：
贞观元年，拜右武候大将军，赐爵吴国公，与长孙无忌、房玄龄、杜如晦四人并食实封千三百户。
——《旧唐书 列传第十八》
而对于秦琼：
六月四日，从诛建成、元吉。事宁，拜左武卫大将军，食实封七百户。
——《旧唐书 列传第十八》
因此，秦琼并没有《隋唐英雄传》里面描写的那么厉害，加上他的官位最低，能在逝世五年还被太宗放于凌烟阁上，可见他在太宗心中的地位还是很高的。