原因有两点，一是因为朱允炆没有及时像他们请求帮助和支援，二是沐家军当时没有多余的精力去支援，因为他们的职责是镇守云南，而且当时沐家军的领导人换成了沐英的二儿子沐晟，沐家军本身的领导是沐英，后来去世之后由沐晟带领，对于帮助朱允炆的责任有所减弱。
其实主要是朱允炆太过自信，认为自己的实力比朱棣强，所以没有及时获得救援导致失败。朱元璋本来是传位给自己的长子主标，可是后来朱标去世了，本来顺位的话应该由第四个儿子朱棣继承大统，谁承想，朱元璋将位置留给了自己的孙子朱允炆，这本身就很让其他的藩王觉得意难平。
结果朱允炆上位后，通过两个大臣的意见开始了削藩，其中势力最强大就是燕王朱棣，所以最后开始了内斗，发起了“靖难之役”，战争持续了三年之久本来最开始朱允炆觉得自己一定会赢，没想到朱棣开始收买人心，最后一路冲向南京，攻打南京。
可是这个时候，朱允炆去寻求救兵为时已晚，都知道王牌军队沐军有三十万人，很庞大，但是他们的首要任务是镇守云南，加上当时的情况，去救援也来不及，因为南京和云南相隔千里，正所谓，远水不能救近火，所以最后朱棣在这场战役中取得了胜利，朱允炆最后失踪。
所以不是朱允炆不用这只王牌军队，而是来不及用，一开始有机会，却因为自负不去请求，后来火烧眉毛了，又来不及了。
历史上的靖难之役也被叫做靖难之变，是发生在明朝时期。明朝的开国皇帝非常喜爱嫡长子朱标，但是可惜的是这位太子早逝，所以最后就选择皇太孙朱允炆继承皇位。深谋远虑的朱元璋因为害怕年幼的朱允炆的皇权被功臣架空，所以就把功臣找借口杀掉。同时以防万一，还为朱允炆留下了一支王牌军队，这支军队就是云南沐家军，那么在靖难之役中，朱允炆为何不动用呢？
首先就是因为朱允炆在最初是占上风的，所以根本就不需要动用这支王牌军队。靖难之役最初，朱允炆还是占据上风的。但是在后期朱允炆因为用人不当，导致朝廷的军队屡屡失败。其实造成这样的局面，朱元璋也有一定的责任，因为朱元璋害怕有权臣威胁到朱允炆的皇位，所以将有能力，有战功的大臣都给杀了，结果造成朱允炆在后期无人可用。所以最后出现失败，让朱棣取得了胜利。
其次就是朱允炆还没有来得及下令。因为在最初朝廷在战争中，还是占据着上风，所以就不需要通知沐家军，让他们继续镇守云南就可以了。哪里想到在后期，朝廷溃不成军，发展太快，朱允炆还没有来得及下令，朱棣就攻进京城。
最主要的是如果沐家军的首领沐英还在世的话，估计会对整个局势非常的关心，说不定会预料到这样的情况，尽早的派兵支援。可惜的是这位对朱元璋非常忠心的人早已去世，所以其后代的忠诚就大打折扣。