最大的原因在我看来其实还是为了隐瞒鸣人的真实身份吧，毕竟整部火影看下来，旋涡一族虽然没几个人了，但是还是有人存在的，而波风却只有水门一个，若是鸣人姓波风的话一下子就被知道是四代儿子了！漩涡鸣人一开始如果就是叫做波风鸣人，那么很明显，很多国家的忍者都会派上忍来杀害这个四代火影的儿子，不然的话会威胁到很多人的地位的。
说句实在话，我想很多人应该都知道波风水门他是木叶的第四代火影，可以说是木叶村子中的一个英雄，受村民敬仰，只不过万事有正面就有反面，波风水门对于其他的忍村而言就是一个死神，一个只会在瞬间收割灵魂的死神，毕竟战争肯定是非常残酷的，水门为木叶立下汗马功劳，这也就意味着，相对地也就结下了很多恩怨。倘若鸣人姓波风的话，那么这样子或许就会让鸣人因为身份暴露而遭受仇家的追杀，这样子便会丧失了和其他人一样的成长环境，而跟着母亲姓旋涡的话，也会最大限度的得以幸存。
因此在火影这部动漫中，虽然五大忍村内的很多人其实都明白漩涡鸣人就是九尾人柱力，当年是强制被封印九尾狐在自己的体内，但是因为鸣人姓旋涡，因此没有多少人知道他其实是四代火影的儿子，漩涡鸣人当年被封印的时候，父亲差不多快要死掉了，四代火影是一个很强大的存在，如果说有人知道四代火影有后代的话，很有可能会有杀身之祸，最主要的是，九尾会再次放出来被人利用。
最后我这边再说一个很多人会说的一个可能，那就是或许水门是入赘的，毕竟鸣人的母亲漩涡玖辛奈隶属于漩涡一族，据传说是涡之国的名门望族，因此波风水门入赘也是有可能的，因此鸣人这种情况下就会随母亲姓。这和佐井入赘到山中家族中，他们的儿子也姓山中，这是一样的道理。
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