引起肛门瘙痒症的原因很多，可分为全身因素与局部因素两类。全身因素引起的肛门瘙痒，原因以对食物、药物过敏者居多。一些人饮酒或食用鸡蛋、鱼、虾及一些刺激性食物，如辣椒、芥末之后，便会引发肛门瘙痒，一些人对某些药物如抗菌素、吗啡、奎宁等过敏，服药后也可引发此症。此外，患一些慢性疾病如糖尿病、风湿病、痛风等，也可伴发肛门瘙痒。患肝胆疾病，胆汁郁积引起血和皮肤内胆盐含量增高，刺激神经末稍，可引起强烈、持久的全身性搔痒。尿毒症患者也有全身瘙痒症出现。据某些专家研究，肛门瘙痒症的发生与神经精神因素及家族遗传有关，一些人在受惊吓过度兴奋或过度紧张时会出现肛门瘙痒的症状，更年期妇女及更年期男子也容易出现肛门瘙痒的症状。老年人出现肛门瘙痒属于老年性瘙痒症，多与皮肤的萎缩、干燥、变性有关。由局部因素引起的肛门瘙痒多见于寄生虫病、肛门皮肤病及各种肛肠疾病。引发肛门瘙痒症的寄生虫病中最常见的是蛲虫病，瘙痒多在晚间睡眠时加重，这是由于睡眠时肛门括约肌变得松弛，雌性蛲虫爬到肛门外产卵从而引起肛门周围奇痒。此外阴虱、滴虫等也可引起肛门瘙痒。肛门皮肤病包括肛门周围湿疹、神经性皮炎、股癣、肛门疣等。患有痔的病人，由于粪便常附着于痔体间或肛门皮肤的皱襞里，也会刺激肛门，引起瘙痒症。痔疮、肛瘘、脱肛、直肠炎及肛门手术后，因肛门周围分泌物增多，刺激皮肤发炎，均会引起肛门周围瘙痒。此外，还有一种原因不明的原发性肛门瘙痒症，这是一种局限性的神经机能障碍性皮肤病，开始限于肛周，尔后可以蔓延到整个会阴及外阴、阴囊部，本病发病机理并不十分明确，一般认为是表皮内游离的神经末稍受物理化学的因素刺激，导致局部组织胺激肽等化学介质释放，作用于神经末稍，产生痒觉。
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