A、调查法首先要明确调查目的和调查对象，并制定合理的调查方案．有时因为调查的范围很大，不可能逐一调查，就要选取一部分调查对象作为样本．调查过程中要如实记录．对调查的结果要进行整理和分析，有时要用数学方法进行统计．因此，在显微镜下观察洋葱表皮细胞，不是调查法．故A错误．
B、实验法是生物研究的主要方法．是利用特定的器具和材料，通过有目的、有步骤的实验操作和观察、记录分析，发现或验证科学结论．因此，在显微镜下观察洋葱表皮细胞，所采用的研究方法是实验法．故B正确．
C、观察法是科学探究的一种基本方法．科学观察可以直接用肉眼，也可以借助放大镜、显微镜望远镜等仪器，或利用照相机、摄像机、录音机等工具，有时还需要测量．科学的观察要有明确的目的；观察时要全面、细致和实事求是，并及时记录下来；要有计划、要耐心；要积极思考，及时记录；要交流看法、进行讨论．因此，在显微镜下观察洋葱表皮细胞，不是观察法．故C错误．
D、文献法也称历史文献法，就是搜集和分析研究各种现存的有关文献资料，从中选取信息，以达到某种调查研究目的方法．它所要解决的是如何在浩如烟海的文献群中选取适用于课题的资料，并对这些资料做出恰当分析和使用．因此，在显微镜下观察洋葱表皮细胞，不是文献法．故D错误．
故选：B．
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