不同类型的高校，无法简单比较。南京晓庄学院的特色是教育，在乡村教育方面有一定名气，而常熟理工学院工科是相对特色优势。
从学科建设方面，常熟理工学院拥有一批国家级立项的专业，如自动化、数学与应用数学是国家级特色专业，材料科学与工程、机械工程、自动化、计算机科学与技术是教育部卓越计划试点专业，新能源科学与工程等为教育部本科综合改革试点专业。而南京晓庄学院的小学教育、学前教育是国家级特色专业建设点及综合改革试点项目。
也就是说，想从事教师职业的话，可选择南京晓庄学院；而想学习机械、材料、自动化、计算机等工科专业则可重点考虑常熟理工学院。