with，in，by这三个介词在表示方式的时候，各自具有不同的功能，用于不同的地方。
1、后接名词的意义不同
with后接表示行为动作的具体工具；by后接表示动作的手段，如交通工具；in表示方式的时候，常常表示使用某种语言或文字，或用某种材料。例如：
with＋有形的具体工具
See with your eyes and listen with your ears. 用眼看，用耳听。
Cut it with scissors. 用剪刀剪。
by＋交通工具或手段
by ship/bus/car 乘船、坐公交，乘车、坐飞机
by air/land/sea 坐飞机、经陆路、海路
They contact with each other by letter. 他们用书信彼此联系。
in＋语言或材料
The letter was written in French. 那封信是用法语写的。
I wrote the letter in ink. 我用钢笔写的那封信。
2、后接名词前是否需要冠词有所不同
with后面的名词一般要有冠词；by后面的名词一律不带冠词；in后面的名词前不带冠词。
You'd better write with a pen. 你最好用钢笔写。
I'll pay by cheque. 我将用支票付款。
I wrote the letter in ink. 我用钢笔写的那封信。
扩展资料：
by 与 with 表示方式的区别：
by 表示抽象的方式和手段，with 表示具体的方法和工具。
The letter was written by hand. 这封信是用手写的（即不是打印的）。（by hand表示一种抽象的手段，是无形的，注意其中没用冠词或其他限定词)
I write with my hand, but he writes with his mouth. 我用手写字，但他却用嘴写字。（with one’s hand表示一种具体的工具，是有形的，注意其中用了物主代词)
in表示方式或手段主要有两个用法：
1、表示用某种语言。如：
What do you call this in English? / How do you say this in English? 这个东西用英语怎么说？
2、表示用某种材料。如：
Write your homework in ink, not in pencil. 用钢笔写家庭作业，不要用铅笔。