建棚当中，防寒沟的设置是非常重要的。但是，目前我们绝大多数温室，或者不设防寒沟，或者防寒沟设的不合理。有的防寒沟在棚外设置，在前沿挖一个30厘米宽、40厘米深的沟，填上草。结果设置之后经过人踩，就失去了防寒的作用。防寒沟应该设置成防寒贮水调温沟。整个棚的四圈都要设置。首先，前沿的防寒沟不应该设置在棚外，应该设置在大棚内的前沿，先挖一道宽30～40厘米、深40厘米的沟，然后在沟底铺上旧薄膜，再用90厘米宽的双面的薄膜（一个筒形的塑料农膜），把它从东到西分段铺上，这个薄膜是一个管子，在薄膜管内灌上水，白天温室里前沿的温度比温室的后半部、中部要高2～3℃，而到晚上前沿的温度要比后半部低3℃以上，容易造成冻害。放上这一管子水，它白天吸热，不会让棚内前沿的温度过高。到了晚上，管子中的水蓄积的热量会向温室内释放，可显著提高前半部的夜间温度，整个温室的温度就提高了。
防寒贮水沟还有一个好处就是浇水的时候，抽管子中的水浇地，浇的是温水，不会降低地温。
防寒沟还应该在这个薄膜管的前沿覆上厚厚的草，最后盖上大棚膜，在薄膜外面压土。如此处理，大棚膜上的水流下来就会流到草中，草受潮之后会发酵，发酵会释放出二氧化碳，这样既起到保温作用，又能给棚内植物进行光合作用提供所需要的二氧化碳。
如此处理最大的好处是，把前部土壤偏湿的问题解决了。大棚前部薄膜直接盖到地上，从薄膜流下来的水，全部在前部土壤当中蓄积起来，导致前部土壤过湿，诱发前部霜霉病、灰霉病、疫病发生。前部一发生病害，就会传染整个大棚。
另外山墙和棚的后半部也要设置防寒沟。这些防寒沟开挖20厘米宽、30厘米深，沟内要用麦糠或者麦秸填满、踩实。这个草的作用既可防止热量外传，又可以吸潮，降低室内空气湿度，减少病害发生。同时吸潮后能够发酵，释放二氧化碳，解决棚内二氧化碳不足的问题。