1、近亲结婚会大大提高隐性遗传病的概率。根据相关资料证明，近亲结婚后代的隐性遗传病将是非近亲结婚后代隐性遗传病的150倍。
2、近亲结婚的某些多基因遗传病的发病率高于非近亲结婚。
据调查，近亲结婚的后代所患的先天性心脏病、无脑儿、脊髓裂变等多基因病的发病率约为1.64%，高于非近亲结婚子女的0.57%。
3、近亲结婚的孩子早期死亡率和畸形率也比较高。
4、近亲结婚的后代体质会比较差，体重较轻，身高较矮。
法律依据：
《婚姻法》第7条规定，有下列情形之一的，禁止结婚：
(一)直系血亲和三代以内的旁系血亲
(二)患有医学上认为不应当结婚的疾病。