先来说第1个原因：车型不同。
开不同的车子往返跑，收费不一样，是因为高速通行费就是按车型来分的。
交通运输行业标准JT/T 489-2019《收费公路车辆通行费车型分类》里面规定的。
车辆通行费分别按照客车、货车、专项作业车这3个系列来收，客车和货车的收费标准是不太一样。
所以如果来的时候是开轿车，回去的时候弄了个皮卡，交的钱就是不同。
另外，交费方式不一样，往返费用也会不同，ETC和现金价格就是不一样的。
《中国公路》期刊上面有论文，《江西通行费计费有新规：现金精确到元，ETC精确到分》上面有提到过。
ETC和现金2种支付方式的收费精度是有差别的，一个四舍五入精确到分的，另一个四舍五入精确到元的。
这种精度不同，就会导致部分车辆通行费发生变化。
再加上ETC用户有时候还能享受折扣，所以说，如果往返的时候，一次用现金，一次用ETC的话，交的钱也是会不一样的。
往返收费里程不同
「嗯」这么讲吧，就算开的车子是一样的，往返同一段高速，再用同样的支付方式，也有可能会存在收费不一样的情况。
因为有的地方会把高速的匝道，以及收费站前面的开放式连接线也算到高速通行费里面的，而且驶入和驶出高速，算的费用不同的。
比如说：江西省交通运输厅、江西省发展和改革委员会、江西省财政厅，就联合下发过一些通知的，具体太长，我也就不跟你讲了。
大概的意思是这样的，就是：进城下高速的时候，收费站前的那段快速路、连接线不收钱，但是出城上高速的时候，就是要收钱的。
有点像：停车场进场不收钱，出场要收钱，顺序、逻辑是这样。
上海也有类似的情况的，不少高速公路的收费计算起点是从收费站前面的连接线就开始的。这就往往会造成往返同一段高速，通行费用是不同的。
系统错误
还有个就是：系统出错了，也是很重要的原因。
ETC是依赖无线射频识别技术工作的，通过收、发无线电波，进行设备间的通信，就有可能会被其他无线电干扰的。
就好比说：手机信号有时候也有可能时好时坏，差的时候打不了电话，也有的，对不对？被干扰了嘛。
大连海事大学苏仲明所著论文，分享给你，《ETC门架系统软件的设计与实现》上面讲。
按照国家标准的要求，门架的识别率应该是不小于99.5%的。
虽然目前ETC设备的识别成功率已经很高了，但它不是100%嘛，偶尔还是会发生不识别、误识别的情况的，尤其是在遇到干扰或者系统调试升级等时候。
比如说：山东省的ETC门架系统。
在2020年完成全国高速公路联网新收费模式系统切换的时候，就遇到了不少因为系统天线受信号干扰导致的计费写入失败、网络不顺畅，导致门架数据没有及时上传等等。
最终使得门架系统有时候不能及时识别，并且上传车辆行驶路径，收费就不一样了。
因为往返两个高速口的实际行驶路径是不相同的，由于高速按实际里程收费，因此来回费用不一样。
以深圳机荷高速白泥坑收费站至水荷收费站往返为例，从白泥坑收费站上机荷高速，往水荷收费站下高速ETC收费4.28元，返回时ETC收费3.8元。
这是因为水荷站只有出口未开设入口，车主往返行驶的并非相同路径，由于水荷站与龙岗站相近，去程为：机荷白泥坑站至水荷站；返程为水官龙岗站至机荷白泥坑站。
按照新的收费政策该路段来回程计费区段不同，而且因为新规对于计费标准也有调整，该区段处于临界点所以会出现计费差距。
扩展资料
2020年1月1日起，广东省所有高速公路、所有收费区间按照实际行驶里程、费率标准精确计费，收费金额统一按照四舍五入原则取整到“分”；ETC车辆分段计费，交易金额取整到“分”；人工收费车辆分段计费，出口合并收费，交易金额四舍五入取整到“元”。
有别于以前的“入口刷卡、出口收费”的封闭式收费模式，分段计费是将高速公路按照相邻的互通立交、入/出口收费站划分为一个个独立的收费区间，各收费区间分别计算费额收费的收费模式。除单独定价的桥梁、隧道项目外，部分路段的客车收费金额相比现行“有升有降”。
1.里程数相同计算方式不同
就算开的车子是一样的，往返同一段高速，再用同样的支付方式，也有可能会存在收费不一样的情况。因为有的地方会把高速的匝道，以及收费站前面的开放式连接线也算到高速通行费里面的，而且驶入和驶出高速，算的费用不同的。比如有些地区下高速的那段快速路、连接线不收钱，但是上高速就会收钱。
2.不同的车型收费不同
开不同的车子往返跑，收费不一样，是因为高速通行费就是按车型来分的。所以如果来的时候是开轿车，回去的时候弄了个皮卡，交的钱就是不同。而且来回如果使用了不同的缴费方式，价格也可能不同，比如ETC的收费是精确到分的，而现金收费是精确到元。
3.系统出现故障，ETC系统是依靠无线射频识别技术，如果在工作过程中被其它无限电干扰就有可能出故障。
出现这三个原因都会造成高速收费来回费用不一样的。