微科盟生科云(Wekemo Bioincloud)：革新宏组学数据分析体验</
刘永鑫团队与微科盟联手，打造了一个用户友好的在线分析平台，专注于宏组学数据处理和可视化</。这个创新平台的官网(http://www.imeta.science)于2024年2月13日正式发布，其背后的研究成果已发表在<iMeta期刊上，DOI为10.1002/imt2.175。
Wekemo Bioincloud的核心亮点在于，它提供了一站式的云流程，集成65个强大工具，支持实时在线分析和互动式可视化。用户可在线编辑矢量图，确保数据隐私的同时享受高效服务。平台支持22个预设的工作流程，涵盖了各类宏组学数据，用户可以根据需求选择适合的算法进行定制分析。
在2023年12月的数据使用报告中，平台的云流程和工具模块分别达到了42.14%和57.86%的使用率，其中，分组聚类热图、LEfSe图和百分比堆积条形图格外受欢迎，分别达到36,098次、34,261次和33,341次使用，显示出其在数据展示和对比分析上的卓越性能。
工具模块分为10个类别，从基因展示到差异比较，功能丰富，如16S rRNA比对和SVG转换。平台支持宏基因组分析，包括基于参考、从头组装和分箱流程，通过12个数据库预测抗生素抗性基因、CAZy、CARD等功能，简化了多组学分析的复杂性。
无论是数据预处理、Metabolic Pathways分析还是Quorum Sensing研究，Wekemo Bioincloud都提供了全面的解决方案，如使用maSigPro进行代谢组时间序列分析，其数据库包含2500+植物和1800+动物代谢物，确保了研究的深度和广度。
作为一款Web应用，Wekemo Bioincloud凭借其技术实力，集成了Trimmomatic、Bowtie等工具，实现了高效的数据预处理和功能鉴定。平台不仅提供22种云流程，还不断集成EasyMicrobiome和EasyMetagenome，计划推出英文版教程，以满足全球科研人员的需求。
刘永鑫研究员，作为平台的通讯作者，与团队成员共同贡献了这个创新成果。他们不仅在微生物组方法开发方面有所建树，还主编了《微生物组实验手册》，拥有丰富的学术影响力。刘教授等主编的iMeta期刊，作为开放获取的平台，凭借其ESCI和Scopus的收录，旨在发表高质量的科研论文，为全球科研界提供一个交流和分享的平台。