子公司必须独立核算，独立申报纳税。?分公司不是独立法人，可以不独立核算，所得税可以在总公司合并汇算清缴。1、企业所得税的规定子公司应当单独计算应纳税额，在注册地缴纳税款，并适用按月(或季)预缴、年底汇算清缴的规定。设立为分公司后，在企业所得税的征管上执行跨地区汇总缴纳企业所得税的规定。相关的企业所得税审批、备案事项，子公司自行收集整理资料，向当地所得税主管税务机关申请。分公司应由总机构收集整理资料，并向总机构所在地所得税主管税务机关申请。2、其他税种的影响增值税上，根据《增值税暂行条例》的规定：固定业户应当向其机构所在地的主管税务机关申报纳税;总机构和分支机构不在同一县(市)的，应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税。因此，无论设立成子公司还是分公司，都需在机构所在地缴纳增值税。其他地税，如房产税、土地使用税，均需在资产所在地纳税;而个人所得税也应在企业生产经营当地缴纳。因此，无论设立成子公司还是分公司，对项目所在地的地税基本不产生影响。
分公司与子公司区别：
区别一、设立方式不同。子公司由公司股东按照《公司法》的规定设立，应当符合《公司法》对公司设立条件和投资方式的要求。分公司由总公司在其住所地之外向当地工商机关申请设立，属于设立公司分支机构。
区别二、法律地位不同。子公司是独立的法人，具有法人资格，拥有独立的名称、公司章程和组织机构，对外以自己的名义从事经营活动。分公司不具有法人资格，没有独立的名称、公司章程和组织机构，以总公司分支机构的名义从事经营活动。
区别三、受控制方式不同。母公司对子公司一般不直接控制，而是通过任免子公司董事会成员、作出投资决策等方式影响子公司的生产经营活动。分公司的人事、业务、财产受总公司的直接控制，在总公司的经营范围内从事经营活动。
区别四、承担债务责任方式不同。子公司作为独立的法人，以子公司的全部财产为限对其债务承担责任。分公司由于没有自己独立的财产，与总公司在财务上统一核算，因此，其经营债务由总公司负责清偿，即总公司以其全部财产为限对分公司在经营活动中的债务承担责任。
区别五、领取的营业执照不同。子公司领取的是企业法人营业执照，有法定代表人姓名字样。分公司领取的是营业执照，有负责人字样。
区别六、 产品包装标注不同。子公司在产品外包装上必须标注自己的名称和住所。分公司可以标注自己的名称、住所，也可以同时标注总公司的名称、住所，还可以只标注总公司的名称、住所。
总公司与母公司区别：
区别一、概念不同。总公司管理母公司，对所属公司在生产经营、资金调度、人事管理等方面行使指挥、管理、监督权利，具有法人资格，独立承担民事责任。母公司指拥有另一公司一定比例以上股份或通过协议方式能对另一个公司实行实际控制公司，具有法人资格，可以独立承担民事责任。
区别二、母公司受总公司的实际控制。总公司对母公司的重大事项拥有实际决定权，能够决定母公司董事会的组成，可以直接行使权力任命董事会董事。
区别三、功能不同。母公司这个名称只具有区别同子公司关系的概念功能，而不具有法律概念功能，比如“母公司”三个字是不能用来工商注册的，而总公司和分公司都是可以的。
区别四、权利不同。母公司是子公司的投资主体。子公司是由母公司投资注册成立的，是具有独立法人地位的、可以独立经营的实体。因此，母公司也可以叫做控股公司，在法律上，母公司享有股东权力。
参考资料来源：百度百科-子公司
本回答被网友采纳总公司一般是相对于分公司而言的；母公司是相对于投资与被投资而言的。从权属上看，总公司和母公司没有什么区别，都是分公司或子公司的上级和投资方。本回答被网友采纳
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