这个要看个人的兴趣，工商企业管理专业主要是学习企业的管理，电子商务专业主要是网上营销类。
工商企业管理专业：这一专业的设置是为了培养在社会主义市场经济条件下从事工商业及其他各类企业管理方面工作的专门人才。经过专业学习，成绩合格者应系统地掌握现代管理理论、有广泛的知识。熟悉各类管理的基本技能和科学方法，能够胜任企业管理工作。 工商管理是研究工商企业经济管理基本理论和一般方法的学科，主要包括企业的经营战略制定和内部行为管理两个方面。
就业前景
工商企业管理专业具有复合性、应用性的特点，是具有很广的适用性的、社会经济各领域有广泛需求的专业。我国经济建设的快速发展和现代企业制度的建立使工商企业管理专业大有用武之地，社会各领域、各单位也需要大量的管理人员，管理专业毕业生在就业市场一直供不应求，职业经理人市场的培育和发展为工商企业管理专业毕业生的未来提供了更广阔的发展空间。该专业毕业生可以从事行政管理、人力资源管理、市场营销、生产管理、物流管理、质量管理、财务管理等岗位的工作。
就业方向
各大、中型企业、外资企业及跨国企业从事生产管理、营销管理和一般业务管理工作，也可从事人力资源管理、财务管理、营销策划、商品调研、市场预测和经济数量分析等工作。
电子商务专业：电子商务专业是融计算机科学、市场营销学、管理学、法学和现代物流于一体的新型交叉学科。培养掌握计算机信息技术、市场营销、国际贸易、管理、法律和现代物流的基本理论及基础知识，具有利用网络开展商务活动的能力和利用计算机信息技术、现代物流方法改善企业管理方法，提高企业管理水平能力的创新型复合型电子商务高级专门人才
专业毕业后，可从事银行的后台运作（网络运作）、企事业单位网站的网页设计、网站建设和维护、或网络编辑、网站内容的维护和网络营销（含国际贸易）、企业商品和服务的营销策划等专业工作，或从事客户关系管理、电子商务项目管理、电子商务活动的策划与运作、电子商务系统开发与维护工作以及在各级学校从事电子商务教学等工作。专科学生，还可以在呼叫中心从事电话营销、电子商务助理等文职的工作。
追问哪个专业好就业？工资在什么段？
追答电子商务好就业，未来的网购比较多，发展比较快。工资这个不一定，看个人能力了。
参考资料：专业介绍