端午节门口放艾草是为了辟邪防瘟疫疾病。
端午在古人心目中是毒日、恶日，在民间信仰中这个思想一直传了下来，所以才有种种求平安、禳解灾异的习俗。其实，这是由于夏季天气燥热，人易生病，瘟疫也易流行；加上蛇虫繁殖，易咬伤人，所以要十分小心，这才形成此习惯。
艾草代表招百福，是一种可以治病的药草，插在门口，可使身体健康。在我国古代就一直是药用植物，针灸里面的灸法，就是用艾草作为主要成分，放在穴道上进行灼烧来治病。
有关艾草可以驱邪的传说已经流传很久，主要是它具备医药的功能而来，像宗懔的《荆楚岁时记》中记载曰“是日采艾为人形，悬于户上，可禳毒气（端午节这天采艾草为人形，挂在门口，可以去除毒气）。”一般人也有在房屋前后栽种艾草，求吉祥的习俗。
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端午节挂艾草的由来
端午在门上悬挂艾草、菖蒲的习俗，据说来源于这样一个传说。唐朝僖宗年间，黄巢领兵造反，这年五月，黄巢大军兵临邓州城下。黄巢骑马到城外勘察地形，在一个村外的路口，遇见一位年轻妇女，背背包袱，一手拉着一个小孩，另一只手却抱着一位年纪较大的男孩，正慌忙逃路。
黄巢以为这个妇女不仁，抽刀欲斩，经询问，方知原来大孩子是妇人大哥的遗孤，小孩子是妇人所亲生，她宁愿让自己的孩子受苦，也不愿让侄儿遭罪，为的是不负大哥托孤之意。
黄巢一听，对这位年轻妇人肃然起敬，认为她是天下少有的义妇，于是挥剑砍下路旁艾草菖蒲，让她拿回家去挂在门上，并严令将士：“进军途中，如遇门挂艾蒲者，须加保护。”
妇人听了，半信半疑，但她回到城里后，还是把这件事情告诉了左邻右舍。第二天正是端午节，黄巢的军队攻打邓州城，只见家家户户门上都挂了艾草菖蒲。黄巢果然信守对那位妇人的承诺，领兵离去。从此，端午节挂艾草菖蒲的习俗就流传了下来。
参考资料来源：人民网-端午节为什么要挂艾草
端午节为什么要在门上挂艾草，很多人不知道怎么回事，快看看
端午节本是纪念屈原的节日。至唐黄巾起义时，黄巢义军攻打中原地区，时值端午。当地官员于是放出风声：“黄巢隔山摇刀，人头落地！”动员民众逃离家园，是为"走黄巢"。实际是使义军无法与民众接触，以制义军不断扩大之势。
中原地区某户人家，男人都外出了，家中只有一妇人与二个小孩，一小孩为亲生，一小孩是她嫂子的遗孤。亲生的小孩刚能行走，她嫂子的遗孤大她自己的小孩一岁。妇人一人带二小孩逃难，背着她嫂子的遗孤，却让自已刚能行走的小孩步行，但却落在后头。走不多远，遇一黄衣人，问：“嫂嫂为何不让大小孩走路，而让小的小孩走路？”妇人如实相告，黄衣人听后甚为感动，道：“你危难之中行忠义之事，已破黄巢之刀，黄巢已无法取你人头，其实你只需在家门口插上艾草，表示你家是忠义之家,黄巢便无奈你何。”言罢竟忽不见。妇人认为是仙人指点，于是回家依言而作，并沿途叫逃难之人插艾草可破黄巢之刀云云。因此妇人平时善良，多行善事,诸多民众都相信，依言在家门口插上艾草不用“走黄巢”，在家中过端午节。
果然，义军过境，见家中插艾草的人家，无人打扰，随军的医生还为民众看病，问疾苦。一时妇人遇仙人指点之事在各地传开，平民之家，不再“走黄巢”，纷纷插艾草过端午，并效妇人行忠义之事。
其实，黄衣人是黄巢义军的前锋谋士，武艺高强。义军所到之处，都是无人村，义军无人支援，成了孤军。谋士知有蹊跷，化成便衣，独自寻找原因，遇是了妇人。忽然不见，只是纵身跳上大树隐藏起来了。谋士小施一计，不仅破了官府的：“黄巢隔山摇刀，人头落地！”谣言，为义军获得民众支持，又使民众积德行善成风，世人于是将此传统继承下来，今天端午节成为“插艾草”的风俗......
悬艾草：民谚说：“清明插柳，端午插艾”。在端午节，人们把插艾和菖蒲作为重要内容之一。家家都洒扫庭除，以菖蒲、艾条插于门眉，悬于堂中。并用菖蒲、艾叶、榴花、蒜头、龙船花，制成人形或虎形，称为艾人、艾虎；制成花环、佩饰，美丽芬芳，妇人争相佩戴，用以驱瘴。