深圳社保一、二、三档的区别在以下几个方面：缴费标准、就医原则、报销原则。
1、缴费标准
职工参加医保一档的，以职工月工资总额8.2％或7.2％的标准按月缴费，其中用人单位缴交6.2％或5.2％，个人缴交2％。医保二档缴费基数为深圳市上年度在岗职工月平均工资，缴费比例为0.8％（基本医保＋地方补充医保），其中单位缴纳0.6％，个人缴纳0.2％。
医保三档缴费基数为深圳市上年度在岗职工月平均工资，缴费比例为0.55％（基本医保＋地方补充医保），其中单位缴纳0.45％，个人缴纳0.1％。
2、就医原则
一档参保人：可在市内任一定点医疗机构就医。二档参保人：门诊在绑定的社康中心就医，住院在市内任一定点的医疗机构就医，门诊大病在规定医疗机构就医。三档参保人：门诊在绑定的社康中心就医，住院及门诊大病在规定医疗机构就医。
3、报销原则
一档参保人：不管是深户还是非深户，都可以到市内任一定点医疗机构看门诊、住院刷卡报销。二档参保人：不管是深户还是非深户，都要到绑定的社康看门诊。如果是住院的话，可以到市内任一定点医疗机构。三档参保人：不管是看门诊还是住院，都是要到绑定的医疗机构。
注意事项：
1、基本医疗保险二档，三档参保人，必须选定本市一家社康中心作为门诊就医的定点医疗机构。
2、参加基本医疗保险一档的人员不需要申请绑定或更改绑定。
3、如果尚未绑定社康，有单位的，提醒单位尽快就近绑定。没有单位的可自己选择绑定。
4、只有参保状态正常者才能申请绑定或者更改绑定。
5、社会保障卡挂失者不能申请绑定或者更改绑定。
深圳医保分三档：
医疗保险一档（深户一档、非深户一档）缴费基数上下限为：7778元-38892元。
医疗保险二档、三档（非深户二档、非深户三档）缴费基数固定为：12964元。
生育保险缴费基数上限同步调整为38892元，下限暂不变，即：2360元-38892元。
残保金缴费基数同步调整为12964元。
