求问：分子生物学中Contig的含义？

Question

在某paper中看到的，标题是PCR，Sequencing，and Contig Assembling
这里的Contig的翻译，以及解释，谢谢

Answer 1

contig就是重叠群的意思。就是基因组分析测序中的一个概念。
把含有STS序列标签位点的基因片段分别测序后，重叠分析就可以得到完整的染色体基因组序列。分析中的用到的一个概念就是重叠群。

物理图谱的制作，可以更好的理解这个概念：
基本原理是把庞大的无从下手的DNA先“敲碎”，再拼接。以Mb、kb、bp作为图距，以DNA探针的STS（sequence tags site）序列为路标。1998 年完成了具有52,000个序列标签位点(STS)，并覆盖人类基因组大部分区域的连续克隆系的物理图谱。构建物理图的一个主要内容是把含有STS对应序列的DNA的克隆片段连接成相互重叠的“片段重叠群（contig）”。用“酵母人工染色体(YAC)作为载体的载有人DNA片段的文库已包含了构建总体覆盖率为100%、具有高度代表性的片段重叠群”，近几年来又发展了可靠性更高的BAC、PAC库或cosmid库等。

参考资料：百度百科

Answer 2

contig最初的解释只是代表鸟枪法打下的一个read，即一个克隆片段。明明翻译为重叠群，为什么刚开始只代表一个克隆片段呢？是因为每个片段在拼接时都是像打补丁一样把不完整的地方补齐，这也就意味着有许多重叠，每个片段作为重叠的一部分，就被叫做a config了。后来，config引申为大家容易理解的相邻的重叠克隆片段拼接好的序列。

参考资料：http://staden.sourceforge.net/contig.html