花芽分化，银杏雌花芽的分化包括珠柄、胚珠及构成它的珠被、珠心、珠托的分化与发育。花芽分化不像被子植物在生长点出现平坦的突起称为花芽分化期，银杏花芽内生长锥分化前后均呈半球形，区别不大，不能套用一般被子植物果树的花芽分化划分，银杏花芽内的花（胚珠）是逐个分化的，在观察时除纵切外还要从横切面加以观察。银杏雌花芽分化划分为未分化，分化始期、盛期、珠被分化期、珠心分化期及珠托分化期。分化始期在短枝顶芽内生长锥的一侧出现珠柄原基，纵切面原基顶端呈平滑的圆弧形，无分叉和缺刻，横切面珠柄原基无背腹之分，有两个维管束。形态分化始期在6月上旬（史继孔、贵阳，何凤仁，扬州）分化盛期在7月底至12月初，分化盛期拖得很长，珠被分化期在12月中旬至2月上旬，珠心分化期在2月中旬到3月上旬，3月上旬至下旬的20多天时间，珠托迅速分化，花芽分化完成，所以要重视春季、6月及采后的追肥。雄花的花芽分化在6月上旬开始，1个混合的雄花芽有5个花序，花药囊长形，淡绿色，有细柄，未成熟前有两个花药囊对生，成熟后分开，每个花药囊内有花粉粒4000～5000粒。银杏的胚芽发育进程很缓慢，采收时多数种子可以看到胚，但不明显，采收后经30～50天的继续发育，始告成熟。郭善基（1984）报道了山东省沂源县发现叶籽银杏，其植物学性状与一般银杏相似，惟同一雌株上除正常胚珠外，约有20%左右的叶胚珠，叶胚珠柄的柄长较正常胚珠柄长1倍，实际即为叶柄，胚珠直接着生在叶上，叶片变小，形似花萼、紧贴球果，球果较小，近球形，带叶。