这个没有绝对的好和不好，要看你投资公司的目的。
如果把公司做大后，赚点钱，就转让了，建议成立自然人控股的公司。如果是想的把公司做大，赚到钱后用于再投资的话，建议公司股东控股。为什么呢？因为税负不同。先说一下，自然人股东控股的情况，企业赚了钱，先缴纳25%的
企业所得税，钱要到自然人股东手里，还需要缴纳20%的
个人所得税。这样合计税负就是40%.如果是公司股东的情况下，企业赚到钱已经交过25%的企业所得税。分红给公司股东，由于公司也是缴纳企业所得税，所以无需再缴税，这样税负是25%。
总结：成立公司的目的是要卖掉公司，那你的钱肯定要到个人股东手上，所以是个人股东直接控股就可以了。如果是成立公司赚到钱用于再投资的话，公司股东可以省去缴纳个人所得税，直接少了15%个点的税负。
拓展资料：
以下是注册内资公司过程中的操作流程和主要事项供您参考：
一．公司查名所需材料如下：
1、法定代表人、股东
身份证复印件或者法人的身份证明复印件；
2、
注册资本金额及各股东投资比例；
3、公司名称字号10个以上；
4、公司主要经营范围、经营地址；
二．流程：
查名－验资－办理工商
营业执照（含刻章）－办理
组织机构代码证－办理税务登记证。
三．时间：
1、查名：五个工作日； 2、验资：三个工作日；
3、营业执照：五个工作日； 4、组织机构代码证：两个工作日；
5、税务登记：十五个工作日。
四、工本费
1、查名 0元 2、验资 （按
注册资金收费）
3、营业执照（按注册资金比例） 4、组织机构代码证、税务登记证