973计划在“十一五”期间要按照《中共中央关于制定国民经济和社会发展第十一个五年规划的建议》的要求，以科学发展观为指导，全面落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006－2020年）》（以下简称《规划纲要》）和《国家“十一五”基础研究发展规划》，面向战略需求，聚焦科学目标，造就将帅人才，攀登科学高峰，实现重点突破，服务长远发展。
面向战略需求。面向当前国民经济、社会发展和国家安全的重大需求，以基础理论的源头创新推动技术创新，形成自主知识产权，提高产业竞争力，服务国民经济建设。聚焦科学目标。遵循基础研究规律，在国家重大需求与科学前沿的结合点上下功夫，解决我国经济、社会和科技自身发展中的重大关键科学问题。造就将帅人才。稳定一支高水平的国家基础研究队伍，组建高水平创新群体，培养优秀创新人才，造就一批能把握宏观战略方向和组织重大课题研究的将帅人才。攀登科学高峰。力争在科学前沿领域取得一批原创性科学成果，在国际科学前沿占有一席之地。实现重点突破。既要根据“择需”原则考虑整体布局，又要“择重、择优”，对重点领域强化部署，加大支持力度。服务长远发展。面向前沿高科技战略领域超前部署基础研究，为新兴产业的发展提供知识储备，为我国可持续发展提供科学支撑，为建设创新型国家做出贡献。 （1）解决制约我国经济社会发展和国家安全中的重大科学问题，为我国可持续发展提供科学基础，为提高我国产业核心竞争力和优化产业结构提供科学支撑，为国家决策提供可靠的科学依据；
（2）在世界科学发展的主流方向和具有我国优势、特色的基础研究领域，取得一批在国际上产生重大影响的原始性创新成果，大幅提升我国在国际科学界的地位；
（3）吸引、凝聚、培养创新人才，造就服务于国家战略目标的人才和创新研究团队；促进重点研究基地的建设，显著提升我国的自主创新能力和解决重大问题的能力。
