四号线票价采用广州地铁票价计算方式：按里程分段计价。起步4公里以内2元；4～12公里范围内每递增4公里加1元；12～24公里范围内每递增6公里加1元；24公里以后，每递增8公里加1元。全线单程最高票价9元。 从2015年5月9日起，广州地铁对4号线实行多项便民方案，其中一项为调整往金州站方向的尾班车时间。经调整，黄村站往金洲站的首班车为6:00，往新造站和金洲站的尾班车统一调整至23:15，为市民“夜归南沙”提供极大便利。
金洲站往黄村站的首尾班车时间不变，首班车为6:21，尾班车为22:15。同时，黄村往金州方向的首班车时间也不变，为6：00。
班车时间 方向 首班车 尾班车换乘路线所在区车站 往金洲 往黄村 往金洲 往黄村 黄村 6:00 － 23:15 － 21号线（未开通） 天河区 车陂 6:03 6:18 23:17 23:04 13号线（未开通） 车陂南 6:06 6:15 23:20 23:01 5号线 万胜围 6:09 6:12 23:22 22:57 8号线 海珠区 官洲 6:12 6:09 23:25 22:54 12号线（未开通）大学城北 6:15 6:06 23:27 22:52 12号线（未开通） 番禺区 大学城南 6:18 6:02 23:31 22:49 7号线、12号线（均未开通） 新造 6:15 6:00 23:33 22:46 官桥（未开通）----17号线（未开通） 石碁 6:16 6:29 23:43 22:38 海傍 6:18 6:27 23:45 22:35 3号线（该段未开通）、8号线（该段未开通） 低涌 6:21 6:24 23:47 22:32 东涌 6:15 6:20 23:51 22:28 南沙区 庆盛6:17 6:2523:5422:30广深港高速铁路黄阁汽车城 6:20 6:29 23:57 22:23 黄阁 6:22 6:26 0:00 22:20 蕉门 6:26 6:24 0:03 22:17 15号线（未开通）金洲 － 6:21 － 22:15 广州地铁对4号线实行多项便民方案，另一项则为全天常态化开行短线车。
经过充分的准备，从2015年5月9日起，四号线将在原有“黄村至金洲”单一交路的基础上，每天按不同的峰期以“1比1”或者“2比1”的比例开行“黄村至新造”短线车“。“1比1”就是隔1趟长线车后开1趟短线车，“2比1”就是隔2趟长线车后开1趟短线车。
开通短线车后，至少8成的该线路乘客受益。
配合短线加开，新的行车间隔如下。 峰期 时间段 运行区间与行车间隔 黄村-新造新造-金洲工作日 早高峰 7:00～9:30 约3分半约7分钟晚高峰16:30～20:00 约4分半约4分半~9分钟（平均约6分半）中峰 9:30～16:30
20:00～21:00 约5分钟约5~10分钟（平均约7分半）低峰 6:21～7:00
21:00～运营结束 约5~9分钟约9分钟周六日 高峰 8:00～20:00 约4分钟约4~8分钟（平均约6分钟）中峰 6:21～8:00
20:00～21:00 约5分钟约5~10分钟（平均约7分半）低峰 21:00～运营结束 约5~9分钟约9分钟注：上表仅供参考。
地铁公司表示，四号线开行短线车只对在“黄村至新造”区段上车，到“石碁至金洲”区段下车的少部分乘客产生影响。“如果需要搭长线车的乘客搭了短线车，可在黄村至新造之间的任一个车站下车，再换坐长线车即可。”地铁公司进一步提醒市民，进入站台后需留意到站显示屏和车站广播，不要抢上抢下。
