DNA分子量大，就算是100bp，差不多是12K，分开很容易，条带比较单一。而蛋白相对来说就小了些，30到40K的蛋白，很常见，而且各蛋白间相差小。多半是大大小小的蛋白混合物。相差小。
并且DNA结构简单，由四种碱基组成，同样100bp速度接近。而蛋白由20种AA组成，各蛋白组成差别大。
所以DNA电泳，不用浓缩胶就可以跑得很好。没必要用浓缩胶。
而蛋白电泳，本身的原因，再加上进入电泳孔的时间不同，如果不用浓缩胶，分跑得很宽而分不开。有了浓缩胶，会在进入分离胶时，让所有的蛋白在同一起跑线上，这一条线，很细很细。
染料在浓缩胶中可以观察得到。