是。
根据官方给出的信息和线索，黄明岐确实是黄琪惠的父亲。在相关家庭关系的描述中，黄明岐被明确指定为黄琪惠的父亲，这表示他们之间存在直接的亲子关系。
在进一步探讨这个问题时，我们可以注意到，亲子关系是一种基于血缘或法律认定的关系，它连接了父母和子女，并构成家庭的基本框架。在这个特定的案例中，黄明岐作为父亲，对黄琪惠的成长、教育和生活起着重要的影响和作用。
综上所述，根据现有的信息和证据，我们可以确认黄明岐是黄琪惠的父亲。这一结论基于对他们家庭关系的直接描述和认定。
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